More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0218 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0218  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
355 aa  708    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3527  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.07 
 
 
355 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9310  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.79 
 
 
355 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0853778  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.54 
 
 
351 aa  490  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9024  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.95 
 
 
353 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  67.62 
 
 
352 aa  477  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0462  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.67 
 
 
357 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6574  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.19 
 
 
353 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.9 
 
 
353 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0261  aspartate semialdehyde dehydrogenase  68.97 
 
 
359 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0266  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.34 
 
 
353 aa  425  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0227  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.22 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0494  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.66 
 
 
352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.89 
 
 
336 aa  320  3e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
348 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
349 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
348 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1400  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
348 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00002128  hitchhiker  5.26638e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3899  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
348 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
349 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
348 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.82392e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
348 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.66 
 
 
337 aa  293  4e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.09 
 
 
349 aa  292  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1448  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
345 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.75 
 
 
365 aa  288  9e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3570  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.52 
 
 
348 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2453  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
348 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000194693  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.33 
 
 
340 aa  282  6.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.15882  hitchhiker  0.00000411486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.9 
 
 
344 aa  279  7e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.2 
 
 
348 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.03 
 
 
347 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2060  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.23 
 
 
347 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.5 
 
 
354 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.301002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.61 
 
 
350 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.88543 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.16 
 
 
338 aa  277  3e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.25 
 
 
339 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.25 
 
 
339 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.07 
 
 
349 aa  276  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0618  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.58 
 
 
352 aa  275  6e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
351 aa  275  9e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.32 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.3 
 
 
338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.32 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.32 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.39 
 
 
351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.51 
 
 
339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.84 
 
 
341 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.05 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2919  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.6 
 
 
340 aa  273  4.0000000000000004e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
348 aa  272  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.41 
 
 
365 aa  272  8.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.13 
 
 
339 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.98 
 
 
341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.85 
 
 
341 aa  269  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.76 
 
 
349 aa  268  8.999999999999999e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2926  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.6 
 
 
348 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
338 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.64 
 
 
339 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.07 
 
 
342 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.85 
 
 
349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21221  aspartate semialdehyde dehydrogenase  41.04 
 
 
345 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3170  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.31 
 
 
348 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00711  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.03 
 
 
343 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.81 
 
 
348 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.62 
 
 
340 aa  264  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3482  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
348 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.89 
 
 
356 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1776  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.71 
 
 
334 aa  262  6.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1252  aspartate semialdehyde dehydrogenase  40.75 
 
 
345 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0064  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  43.19 
 
 
340 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.75 
 
 
351 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
335 aa  260  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.17 
 
 
353 aa  260  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4362  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.24 
 
 
351 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2939  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.44 
 
 
347 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0514925  hitchhiker  0.00000205933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.41 
 
 
349 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1077  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
352 aa  260  3e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000750093  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.81 
 
 
345 aa  259  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
347 aa  259  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.14 
 
 
347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28856  predicted protein  38.87 
 
 
383 aa  259  6e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606954  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0587  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.4 
 
 
345 aa  259  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2465  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.37 
 
 
347 aa  259  7e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.844771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2268  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
347 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2436  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
347 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606943  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  41.09 
 
 
337 aa  258  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1270  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.97 
 
 
338 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000102592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
341 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2530  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.79 
 
 
347 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00134439  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.2 
 
 
342 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.79 
 
 
347 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132113  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.53 
 
 
341 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2452  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.79 
 
 
347 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1940  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
364 aa  257  2e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2392  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.32 
 
 
347 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04100  aspartate semialdehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
346 aa  257  3e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.917016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2228  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.79 
 
 
347 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0790084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.55 
 
 
349 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>