More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0560 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
355 aa  698    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  76.01 
 
 
351 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.43 
 
 
351 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.73 
 
 
349 aa  502  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.15 
 
 
341 aa  491  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0695  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  73.28 
 
 
353 aa  488  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.14 
 
 
349 aa  482  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  73.47 
 
 
342 aa  484  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.81 
 
 
356 aa  483  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.05 
 
 
347 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.09 
 
 
353 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.01 
 
 
345 aa  478  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.39 
 
 
344 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.52 
 
 
344 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.52 
 
 
344 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.52 
 
 
344 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.62 
 
 
366 aa  461  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.25 
 
 
341 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.25 
 
 
341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.59 
 
 
341 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  64.2 
 
 
365 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  65.14 
 
 
365 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0130  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 
355 aa  422  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.01 
 
 
349 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0112  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.76 
 
 
341 aa  359  5e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.241314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.51 
 
 
347 aa  313  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.63 
 
 
339 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.63 
 
 
339 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.61 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.01 
 
 
336 aa  287  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.6 
 
 
332 aa  287  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.88 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.28 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.02 
 
 
342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  49.42 
 
 
352 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.63 
 
 
341 aa  281  8.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.32 
 
 
337 aa  280  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.25 
 
 
348 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.24 
 
 
341 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0997  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.52 
 
 
328 aa  281  2e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.88 
 
 
339 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.25 
 
 
335 aa  280  2e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.87 
 
 
339 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.86 
 
 
339 aa  278  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.5 
 
 
342 aa  278  8e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.5 
 
 
340 aa  278  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
349 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.38 
 
 
332 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3527  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.43 
 
 
355 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.25 
 
 
325 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.59 
 
 
341 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.86 
 
 
353 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.31 
 
 
339 aa  275  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.74 
 
 
354 aa  275  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.301002 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.63 
 
 
333 aa  275  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.85 
 
 
336 aa  275  7e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.69 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.14 
 
 
359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.69 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.63 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  44.73 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.39 
 
 
325 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.94 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0218  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.05 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4618  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.16 
 
 
342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.76 
 
 
329 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9310  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.19 
 
 
355 aa  272  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0853778  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.7 
 
 
344 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.01 
 
 
339 aa  272  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
338 aa  272  8.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.3 
 
 
347 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.87 
 
 
338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9024  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.28 
 
 
353 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.17 
 
 
348 aa  269  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3482  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.05 
 
 
348 aa  268  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
344 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.14 
 
 
344 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0044  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
340 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
344 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
340 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0034  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.2 
 
 
340 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1376  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0300827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.46 
 
 
350 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.88543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.14 
 
 
344 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.33 
 
 
344 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.42 
 
 
344 aa  266  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.14 
 
 
344 aa  266  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.57 
 
 
341 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
344 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3501  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.54 
 
 
337 aa  265  8e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.465584 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.13 
 
 
349 aa  265  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.13 
 
 
349 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.93 
 
 
337 aa  265  8.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.13 
 
 
348 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.13 
 
 
348 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
345 aa  264  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.61 
 
 
340 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>