More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0863 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  94.97 
 
 
338 aa  668    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  96.15 
 
 
338 aa  672    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
338 aa  694    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.78 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.7 
 
 
339 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.34 
 
 
341 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.43 
 
 
340 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.7 
 
 
340 aa  388  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.97 
 
 
340 aa  388  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  57.83 
 
 
348 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.53 
 
 
351 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.93 
 
 
349 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0350  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.99 
 
 
334 aa  378  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.06 
 
 
339 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.49 
 
 
339 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.49 
 
 
339 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.16 
 
 
349 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.93 
 
 
339 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1066  aspartate semialdehyde dehydrogenase  57.83 
 
 
335 aa  374  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.058115  hitchhiker  0.00506315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.72 
 
 
336 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.33 
 
 
335 aa  368  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.19 
 
 
339 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.13 
 
 
329 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.487501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.5 
 
 
347 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.94 
 
 
340 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.83 
 
 
329 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2919  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.8 
 
 
340 aa  364  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  56.46 
 
 
339 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3570  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.75 
 
 
348 aa  359  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.75 
 
 
349 aa  359  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.71 
 
 
348 aa  358  5e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.33 
 
 
336 aa  358  7e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
344 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.8 
 
 
344 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.26 
 
 
325 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.96 
 
 
332 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.705444  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
333 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.21 
 
 
344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.92 
 
 
344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.95 
 
 
325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2453  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.46 
 
 
348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000194693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.46 
 
 
348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.46 
 
 
349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.46 
 
 
348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.46 
 
 
349 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04100  aspartate semialdehyde dehydrogenase  52.85 
 
 
346 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.917016 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.46 
 
 
348 aa  355  5e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
344 aa  355  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
344 aa  355  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.46 
 
 
348 aa  355  5e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.82392e-61 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1270  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.5 
 
 
338 aa  355  6.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000102592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3899  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.17 
 
 
348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.89 
 
 
344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  55.49 
 
 
332 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1400  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.17 
 
 
348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00002128  hitchhiker  5.26638e-21 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.89 
 
 
344 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2929  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.18 
 
 
344 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.18 
 
 
344 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  0.305752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
344 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0587  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.8 
 
 
345 aa  351  8.999999999999999e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.4 
 
 
350 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.88543 
 
 
-
 
NC_002950  PG0571  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.65 
 
 
337 aa  349  4e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.12 
 
 
348 aa  349  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.6 
 
 
354 aa  349  5e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.301002 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  54.52 
 
 
340 aa  349  5e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.59 
 
 
344 aa  348  6e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
344 aa  348  9e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2060  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.71 
 
 
347 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.18 
 
 
344 aa  347  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.18 
 
 
344 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.3 
 
 
344 aa  346  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1949  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.27 
 
 
339 aa  345  4e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2775  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.05 
 
 
340 aa  345  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.85 
 
 
340 aa  345  5e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.85 
 
 
340 aa  345  6e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1748  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.46 
 
 
360 aa  344  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115714  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
344 aa  344  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.59 
 
 
340 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2465  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.56 
 
 
347 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.844771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.04 
 
 
332 aa  343  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4362  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.4 
 
 
351 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2701  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.57 
 
 
343 aa  343  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2926  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.19 
 
 
348 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.92 
 
 
344 aa  342  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.3 
 
 
344 aa  342  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
344 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1051  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.3 
 
 
358 aa  342  8e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000545446  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.41 
 
 
344 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.4 
 
 
347 aa  341  9e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.25 
 
 
342 aa  341  9e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  49.1 
 
 
337 aa  341  9e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2530  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.4 
 
 
347 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00134439  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.03 
 
 
357 aa  340  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3170  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.89 
 
 
348 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2452  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.4 
 
 
347 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.56 
 
 
345 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2228  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.4 
 
 
347 aa  339  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0790084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.64 
 
 
338 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
336 aa  338  8e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3732  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.51 
 
 
336 aa  338  9e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357313  normal  0.740513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>