More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2062 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
340 aa  698    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  80 
 
 
340 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  73.53 
 
 
340 aa  531  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  74.12 
 
 
340 aa  532  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1715  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  77.94 
 
 
340 aa  527  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2152  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  73.82 
 
 
338 aa  521  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000198984  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1340  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.85 
 
 
341 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.665671 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0800  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  70.59 
 
 
340 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000180575  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1393  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.68 
 
 
338 aa  511  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.88 
 
 
340 aa  504  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.88 
 
 
340 aa  502  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2308  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.09 
 
 
338 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000121331  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2443  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.68 
 
 
338 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000737036  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3070  aspartate semialdehyde dehydrogenese  71.09 
 
 
338 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2744  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.8 
 
 
338 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000610142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.8 
 
 
338 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000159168  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2761  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.8 
 
 
338 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339959  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1424  aspartate semialdehyde dehydrogenase  71.39 
 
 
338 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000300384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1489  aspartate semialdehyde dehydrogenase  71.39 
 
 
338 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000183684  normal  0.923378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1615  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.8 
 
 
338 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000415846  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.18 
 
 
340 aa  497  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1484  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  69.62 
 
 
338 aa  497  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0171916  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1477  aspartate semialdehyde dehydrogenase  71.09 
 
 
338 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000311076  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1613  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.44 
 
 
338 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000186594  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.55 
 
 
338 aa  485  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000971394  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1650  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.85 
 
 
338 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00338188  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.76 
 
 
338 aa  478  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3805  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.24 
 
 
339 aa  469  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01202  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.29 
 
 
338 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1073  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.19 
 
 
337 aa  463  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.37 
 
 
341 aa  462  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.77 
 
 
342 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1691  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65 
 
 
338 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277188  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03103  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.19 
 
 
337 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.4 
 
 
340 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.4 
 
 
340 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002872  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.9 
 
 
337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797453  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.31 
 
 
344 aa  448  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.31 
 
 
344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.38 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0940  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 
340 aa  441  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.281567  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  61.65 
 
 
339 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.18 
 
 
339 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.83 
 
 
341 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.88 
 
 
339 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.01 
 
 
340 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.82 
 
 
339 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  59.88 
 
 
348 aa  394  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.82 
 
 
339 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.56 
 
 
351 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  60.88 
 
 
339 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.84 
 
 
349 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.73 
 
 
349 aa  381  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1066  aspartate semialdehyde dehydrogenase  59.16 
 
 
335 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.058115  hitchhiker  0.00506315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.92 
 
 
340 aa  378  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.36 
 
 
357 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.86 
 
 
339 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.86 
 
 
339 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.29 
 
 
344 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.87 
 
 
344 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.36 
 
 
342 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2775  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.33 
 
 
340 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.69 
 
 
344 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.33 
 
 
348 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.85 
 
 
341 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.27 
 
 
344 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.87 
 
 
344 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.33 
 
 
335 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.29 
 
 
337 aa  364  1e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.75 
 
 
345 aa  363  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.25 
 
 
341 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.1 
 
 
344 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.68 
 
 
344 aa  362  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.8 
 
 
344 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.61 
 
 
344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.61 
 
 
344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.98 
 
 
344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.98 
 
 
344 aa  360  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.27 
 
 
344 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0350  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.33 
 
 
334 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.98 
 
 
344 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.27 
 
 
344 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.41 
 
 
344 aa  359  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.98 
 
 
344 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3240  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.63 
 
 
340 aa  357  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.94 
 
 
343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.08 
 
 
344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  0.305752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2929  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.08 
 
 
344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.38 
 
 
344 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.79 
 
 
344 aa  354  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
345 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.41 
 
 
344 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0114  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.22 
 
 
340 aa  351  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918447 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3459  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.63 
 
 
340 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.98 
 
 
359 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.12 
 
 
329 aa  349  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.61 
 
 
340 aa  348  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.55 
 
 
336 aa  347  1e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.28 
 
 
349 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0306509  normal  0.940701 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.89 
 
 
338 aa  345  8.999999999999999e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>