More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6574 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6574  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
353 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0261  aspartate semialdehyde dehydrogenase  85.06 
 
 
359 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  76.29 
 
 
353 aa  534  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.93 
 
 
351 aa  528  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  74.29 
 
 
352 aa  524  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9024  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.57 
 
 
353 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3527  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.88 
 
 
355 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0218  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.19 
 
 
355 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0462  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.03 
 
 
357 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9310  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.06 
 
 
355 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0853778  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0266  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.48 
 
 
353 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0227  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.19 
 
 
353 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0494  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.16 
 
 
352 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.24 
 
 
336 aa  309  4e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1448  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
345 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  49.59 
 
 
365 aa  296  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.71 
 
 
349 aa  292  7e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
349 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.67 
 
 
347 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.14 
 
 
344 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
337 aa  287  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.14 
 
 
344 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.14 
 
 
344 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.86 
 
 
337 aa  286  4e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.15 
 
 
340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.15882  hitchhiker  0.00000411486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.31 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.31 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.34 
 
 
351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1776  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.57 
 
 
334 aa  282  5.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.85 
 
 
339 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.99 
 
 
341 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
347 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4362  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.76 
 
 
351 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.87 
 
 
338 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
338 aa  280  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
348 aa  279  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
349 aa  280  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
348 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
348 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.82392e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
349 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
348 aa  278  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2919  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
340 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3570  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.15 
 
 
348 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.54 
 
 
341 aa  277  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
349 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.13 
 
 
349 aa  276  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
340 aa  276  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.16 
 
 
365 aa  276  5e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.85 
 
 
344 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3899  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
348 aa  275  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1400  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
348 aa  275  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00002128  hitchhiker  5.26638e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2060  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.8 
 
 
347 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2453  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.93 
 
 
348 aa  275  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000194693  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2926  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.46 
 
 
353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.31 
 
 
339 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.99 
 
 
340 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.01 
 
 
347 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.87 
 
 
348 aa  271  9e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42 
 
 
350 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.88543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.09 
 
 
356 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3170  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.57 
 
 
348 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.16 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4359  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.55 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657095  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.64 
 
 
339 aa  269  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.63 
 
 
341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.58 
 
 
345 aa  268  7e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
344 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.86 
 
 
344 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00711  aspartate semialdehyde dehydrogenase  44.41 
 
 
343 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
342 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.31 
 
 
342 aa  268  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.28 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3482  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.09 
 
 
348 aa  266  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0587  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
345 aa  266  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.94 
 
 
348 aa  265  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
355 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.09 
 
 
354 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.301002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.4 
 
 
344 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.59 
 
 
332 aa  263  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.705444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.23 
 
 
340 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
359 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
341 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28856  predicted protein  40.79 
 
 
383 aa  261  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606954  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1748  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.13 
 
 
360 aa  261  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0067  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
340 aa  260  3e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0618  aspartate semialdehyde dehydrogenase  40.56 
 
 
352 aa  259  4e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  44.19 
 
 
339 aa  258  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.94 
 
 
348 aa  258  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.36 
 
 
349 aa  258  9e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21221  aspartate semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 
345 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.43 
 
 
340 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.23 
 
 
335 aa  258  1e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.11 
 
 
344 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1252  aspartate semialdehyde dehydrogenase  39.88 
 
 
345 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1641  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
332 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000438606  normal  0.466828 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0130  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.35 
 
 
355 aa  257  2e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0112  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.39 
 
 
341 aa  257  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.241314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>