More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2011 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
353 aa  708    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.22 
 
 
349 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  76.18 
 
 
356 aa  524  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0695  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.71 
 
 
353 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  73.39 
 
 
344 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  73.39 
 
 
344 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  73.39 
 
 
344 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  72.91 
 
 
351 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  73 
 
 
342 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.11 
 
 
341 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.22 
 
 
344 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.26 
 
 
341 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.14 
 
 
347 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.06 
 
 
351 aa  485  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.97 
 
 
341 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.64 
 
 
341 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.09 
 
 
355 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.59 
 
 
349 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.79 
 
 
345 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.63 
 
 
366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  65.01 
 
 
365 aa  435  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.06 
 
 
349 aa  428  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  61.47 
 
 
365 aa  425  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0130  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.26 
 
 
355 aa  414  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0112  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.1 
 
 
341 aa  353  2e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.241314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.01 
 
 
347 aa  323  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.17 
 
 
340 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.72 
 
 
339 aa  315  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.28 
 
 
342 aa  312  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
339 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
339 aa  308  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
339 aa  308  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
349 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
341 aa  305  7e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.13 
 
 
349 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.86 
 
 
344 aa  300  4e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.86 
 
 
344 aa  299  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.51 
 
 
340 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  50.14 
 
 
339 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.73 
 
 
339 aa  295  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.72 
 
 
339 aa  293  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.43 
 
 
340 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.2 
 
 
344 aa  289  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.28 
 
 
341 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.52 
 
 
336 aa  289  6e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.95 
 
 
341 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.66 
 
 
337 aa  287  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.38 
 
 
332 aa  287  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.54 
 
 
344 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.45 
 
 
332 aa  286  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.96 
 
 
344 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
337 aa  285  9e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.35 
 
 
344 aa  285  9e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.8 
 
 
348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.84 
 
 
341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.85 
 
 
359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.2 
 
 
353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.49 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.14 
 
 
340 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.14 
 
 
340 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.7 
 
 
325 aa  282  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.26 
 
 
344 aa  282  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  46.02 
 
 
340 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.2 
 
 
338 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.91 
 
 
352 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.8 
 
 
344 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.96 
 
 
344 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.74 
 
 
340 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
344 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.35 
 
 
344 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.07 
 
 
357 aa  279  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.8 
 
 
344 aa  279  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.22 
 
 
344 aa  279  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.61 
 
 
338 aa  278  7e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.31 
 
 
340 aa  278  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0034  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.83 
 
 
340 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.96 
 
 
344 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
344 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.48 
 
 
340 aa  278  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.15882  hitchhiker  0.00000411486 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.13 
 
 
325 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.79 
 
 
344 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
344 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.61 
 
 
333 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.26 
 
 
342 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.22 
 
 
343 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.07 
 
 
344 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.07 
 
 
354 aa  276  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.301002 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3482  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.35 
 
 
348 aa  276  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
336 aa  276  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.38 
 
 
347 aa  275  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0044  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.25 
 
 
340 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1715  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.16 
 
 
340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1376  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.25 
 
 
340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0300827  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0997  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.22 
 
 
328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6574  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.46 
 
 
353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>