More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0283 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
366 aa  716    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.65 
 
 
351 aa  508  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  76.66 
 
 
351 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.84 
 
 
349 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.93 
 
 
349 aa  475  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.62 
 
 
355 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.55 
 
 
341 aa  468  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.93 
 
 
342 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  68.26 
 
 
365 aa  467  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.11 
 
 
353 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0695  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.6 
 
 
353 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.52 
 
 
347 aa  461  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.83 
 
 
344 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.83 
 
 
344 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.83 
 
 
344 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.11 
 
 
344 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.19 
 
 
345 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.23 
 
 
356 aa  438  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  67.05 
 
 
365 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0130  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.82 
 
 
355 aa  431  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.48 
 
 
341 aa  414  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.98 
 
 
341 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.4 
 
 
341 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  62.46 
 
 
349 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0112  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.36 
 
 
341 aa  330  2e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.241314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.26 
 
 
347 aa  316  4e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.37 
 
 
340 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.29 
 
 
339 aa  289  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.57 
 
 
339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.96 
 
 
332 aa  286  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.71 
 
 
339 aa  285  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.15 
 
 
348 aa  285  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.41 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.72 
 
 
342 aa  282  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
341 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.57 
 
 
336 aa  280  3e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0997  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.25 
 
 
328 aa  279  5e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.01 
 
 
340 aa  279  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.4 
 
 
338 aa  279  6e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.01 
 
 
340 aa  279  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.04 
 
 
337 aa  278  7e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.18 
 
 
351 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.24 
 
 
341 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
325 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.57 
 
 
335 aa  276  3e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.09 
 
 
339 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.09 
 
 
339 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
339 aa  275  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.82 
 
 
325 aa  275  9e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.03 
 
 
340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.02 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.85 
 
 
339 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.04 
 
 
344 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.04 
 
 
344 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.16 
 
 
349 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.96 
 
 
338 aa  269  5e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.48 
 
 
344 aa  269  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.88 
 
 
341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.14 
 
 
344 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.88 
 
 
349 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.43 
 
 
344 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.01 
 
 
344 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.7 
 
 
348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.01 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
340 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28856  predicted protein  43.49 
 
 
383 aa  265  5.999999999999999e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606954  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.29 
 
 
344 aa  265  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.58 
 
 
339 aa  265  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.57 
 
 
344 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44 
 
 
344 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44 
 
 
344 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.18 
 
 
340 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1691  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.5 
 
 
338 aa  263  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277188  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.73 
 
 
351 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.16 
 
 
350 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.88543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.15 
 
 
344 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  45.45 
 
 
340 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.34 
 
 
353 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.07 
 
 
329 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.74 
 
 
352 aa  262  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.38 
 
 
340 aa  262  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
344 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  0.305752 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
344 aa  262  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0800  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  43.7 
 
 
340 aa  262  6.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000180575  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2929  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
344 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.55 
 
 
343 aa  262  6.999999999999999e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3501  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
337 aa  262  8e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.465584 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.14 
 
 
332 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.14 
 
 
344 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.15 
 
 
344 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.33 
 
 
342 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.7 
 
 
357 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.99 
 
 
336 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.68 
 
 
337 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.14 
 
 
344 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.29 
 
 
344 aa  260  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.3 
 
 
354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.301002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
344 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.59 
 
 
347 aa  259  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>