More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3893 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3893  GntR domain protein  100 
 
 		 262 aa  508  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0609104  normal  0.0327557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3975  transcriptional regulator  58.74 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198442  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5706  GntR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 237 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5327  GntR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 237 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.941798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5416  GntR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 237 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.88633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5910  GntR domain-containing protein  53.42 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0589896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0501  GntR domain-containing protein  49.56 
 
 		 237 aa  205  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5298  GntR domain-containing protein  53.15 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3641  GntR domain protein  48.64 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4786  GntR domain protein  51.82 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1134  GntR domain protein  46.98 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2198  GntR domain protein  45.25 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000682007 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1947  GntR domain protein  45.07 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24170  transcriptional regulator, GntR family  45.81 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125788  normal  0.0229036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2450  GntR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3527  GntR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6827  GntR domain protein  43.12 
 
 		 238 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  36.7 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  35.02 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  36.16 
 
 		 239 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  32.46 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1899  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.671252  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  32.61 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1760  GntR domain protein  33.49 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  35.22 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  32.43 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1379  GntR domain protein  37.56 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.260247  normal  0.895969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  34.03 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  33.48 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  36.67 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  33.33 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  36.84 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  27.49 
 
 		 229 aa  92  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  29.36 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  32.7 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  29.36 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  29.36 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  30.99 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.82 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  29.82 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  29.82 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  29.82 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  34.98 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  29.82 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  29.82 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  29.82 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  29.82 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  29.82 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  30.52 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  36.67 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  35.35 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 238 aa  89  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 		 192 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  37.5 
 
 		 192 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 		 192 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  28 
 
 		 228 aa  88.6  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  34.1 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  28.96 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  26.19 
 
 		 229 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 229 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 229 aa  86.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  32.55 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 245 aa  85.5  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  34.63 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  33.63 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3302  GntR domain protein  38.74 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  29.09 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5993  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127437 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4123  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860554  normal  0.0423809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  34.3 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  26.42 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4212  GntR domain protein  26.42 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  26.42 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000443765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5191  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000012685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  26.42 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  31.58 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  25.7 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  25.7 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173473  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8406  regulatory protein GntR HTH  35.9 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5704  GntR domain protein  33.65 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>