More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5416 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_5416  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  470  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.88633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5327  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  470  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.941798  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5706  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  470  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5910  GntR domain-containing protein  87.18 
 
 		 238 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0589896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0501  GntR domain-containing protein  83.26 
 
 		 237 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3975  transcriptional regulator  60.09 
 
 		 237 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198442  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1134  GntR domain protein  50.89 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3641  GntR domain protein  50.66 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3893  GntR domain protein  54.71 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0609104  normal  0.0327557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5298  GntR domain-containing protein  51.11 
 
 		 232 aa  198  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4786  GntR domain protein  51.57 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2198  GntR domain protein  46.81 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000682007 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1947  GntR domain protein  44.83 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3527  GntR family transcriptional regulator  50.9 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24170  transcriptional regulator, GntR family  50.25 
 
 		 238 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125788  normal  0.0229036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2450  GntR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6827  GntR domain protein  39.91 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  34.98 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  35.75 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  35.14 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  32.75 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  34.88 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  37.21 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  38.14 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  36.77 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  38.14 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  34.42 
 
 		 261 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1899  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.671252  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  31.43 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  31.98 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  39.01 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  39.01 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  39.01 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  35.93 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  33.78 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  37.33 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  31.56 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  37.1 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  37.21 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  38.69 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  34.91 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0632  GntR domain-containing protein  37.75 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  35.5 
 
 		 261 aa  99  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1379  GntR domain protein  36.07 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.260247  normal  0.895969 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  34.1 
 
 		 242 aa  98.6  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  35.24 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1760  GntR domain protein  35.71 
 
 		 277 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0657  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3302  GntR domain protein  36.41 
 
 		 268 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  34.3 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5993  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  29.72 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  29.72 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  29.72 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  34.08 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  30.66 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  34.07 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1867  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.25 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  29.25 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  29.25 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  29.25 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  29.25 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  29.25 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  29.25 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  29.25 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  29.25 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  36.62 
 
 		 266 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  30.72 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  36.2 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  29.24 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  35.88 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  32 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8406  regulatory protein GntR HTH  34.13 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3478  GntR domain protein  31.92 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.554366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  26.98 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  26.98 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173473  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  30.09 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  30.09 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3766  GntR domain protein  31.46 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1667  GntR domain-containing protein  29.86 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0248117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>