More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1134 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1134  GntR domain protein  100 
 
 		 244 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3527  GntR family transcriptional regulator  75.1 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5298  GntR domain-containing protein  53.1 
 
 		 232 aa  214  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24170  transcriptional regulator, GntR family  59.01 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125788  normal  0.0229036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3641  GntR domain protein  51.58 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5327  GntR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.941798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5416  GntR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.88633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5706  GntR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5910  GntR domain-containing protein  51.57 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0589896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3975  transcriptional regulator  49.11 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198442  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2198  GntR domain protein  47.47 
 
 		 241 aa  194  8.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000682007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0501  GntR domain-containing protein  48.17 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1947  GntR domain protein  43.72 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2450  GntR family transcriptional regulator  48.73 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4786  GntR domain protein  42.55 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3893  GntR domain protein  47.14 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0609104  normal  0.0327557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6827  GntR domain protein  41.44 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  35.62 
 
 		 235 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  31.88 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  33.18 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  30.64 
 
 		 228 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  29.26 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  30.23 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1760  GntR domain protein  31.65 
 
 		 277 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1899  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 241 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.671252  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1379  GntR domain protein  34.39 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.260247  normal  0.895969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  28.95 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  32.02 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 238 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 238 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 238 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  28.89 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  28.89 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  30.3 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  34.09 
 
 		 274 aa  92  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  28.07 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  30.33 
 
 		 232 aa  92  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  31.56 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  32.43 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  29.38 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  35.09 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  29.38 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  29.38 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  29.02 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  32.51 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  30.7 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.38 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  29.38 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  29.38 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  29.38 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3478  GntR domain protein  32.34 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.554366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  29.38 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  29.38 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  29.38 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  29.38 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  30.33 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  31.61 
 
 		 244 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  30.19 
 
 		 241 aa  86.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  29.58 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  34.8 
 
 		 253 aa  85.5  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  30.63 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  28.37 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2131  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  26.87 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  32.27 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  36.52 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  30.73 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  26.17 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  31.43 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3766  GntR domain protein  31.6 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  30.21 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  30.92 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  31.22 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  30.18 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  24.15 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>