More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1760 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1760  GntR domain protein  100 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2198  GntR domain protein  35.04 
 
 		 241 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000682007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  36.55 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5298  GntR domain-containing protein  37 
 
 		 232 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3975  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198442  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  32.11 
 
 		 229 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1947  GntR domain protein  32.9 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24170  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125788  normal  0.0229036 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  34.4 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3641  GntR domain protein  37.43 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  34.06 
 
 		 235 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  34.74 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4786  GntR domain protein  36.73 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  35.63 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  33.18 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  34.84 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  32.03 
 
 		 238 aa  102  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6827  GntR domain protein  38.12 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2450  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  30.28 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1379  GntR domain protein  36.64 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.260247  normal  0.895969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1725  GntR domain protein  30.17 
 
 		 241 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3527  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2512  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.109373 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  34.1 
 
 		 287 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 244 aa  95.9  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  36.28 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1134  GntR domain protein  31.65 
 
 		 244 aa  94  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  29.74 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  29.74 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  30.26 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1259  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.268862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  36.07 
 
 		 241 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1821  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1974  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0150  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0405244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1742  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1016  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5910  GntR domain-containing protein  35.16 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0589896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  31.49 
 
 		 240 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  29.18 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 238 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 238 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 238 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  33.07 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  32.57 
 
 		 239 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  32.09 
 
 		 237 aa  89  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1682  GntR domain-containing protein  30.92 
 
 		 238 aa  89.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 238 aa  89  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  34.25 
 
 		 252 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  31.9 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0657  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  26.38 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  27.56 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1667  GntR domain-containing protein  27.85 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0248117 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1526  GntR domain-containing protein  29.74 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.72314 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1070  GntR-like  29.74 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5327  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 237 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.941798  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  34.7 
 
 		 234 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5706  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 237 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1550  GntR domain-containing protein  29.74 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5416  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 237 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.88633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3302  GntR domain protein  37.04 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0501  GntR domain-containing protein  40.12 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 237 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  36.36 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1867  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 245 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  31.47 
 
 		 253 aa  85.5  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4692  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468803  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2515  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0149634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1804  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 237 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  32.64 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  44.35 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0632  GntR domain-containing protein  44.23 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  44.35 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  44.35 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3893  GntR domain protein  33.49 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0609104  normal  0.0327557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  32.75 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  27.19 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4212  GntR domain protein  27.19 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4123  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860554  normal  0.0423809 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  27.19 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  27.19 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000443765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5191  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000012685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  33.51 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>