More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1070 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1070  GntR-like  100 
 
 		 238 aa  470  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1526  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 238 aa  470  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.72314 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1550  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 238 aa  470  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4692  GntR family transcriptional regulator  98.32 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468803  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  98.74 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  98.74 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1682  GntR domain-containing protein  96.22 
 
 		 238 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119908 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1742  GntR family transcriptional regulator  79.32 
 
 		 237 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1259  GntR family transcriptional regulator  79.32 
 
 		 237 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.268862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1016  GntR family transcriptional regulator  79.32 
 
 		 237 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1821  GntR family transcriptional regulator  79.32 
 
 		 237 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1974  GntR family transcriptional regulator  79.32 
 
 		 237 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0150  GntR family transcriptional regulator  79.32 
 
 		 237 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0405244  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2512  GntR family transcriptional regulator  74.06 
 
 		 239 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.109373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1725  GntR domain protein  73.44 
 
 		 241 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2515  GntR family transcriptional regulator  79.75 
 
 		 237 aa  338  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0149634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1804  GntR family transcriptional regulator  79.75 
 
 		 237 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1667  GntR domain-containing protein  73.66 
 
 		 248 aa  338  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0248117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4715  GntR domain protein  41.67 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  34.73 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2976  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3101  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161645  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2284  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 439 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1325  GntR family regulatory protein  41.23 
 
 		 379 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  37.27 
 
 		 239 aa  124  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  34.31 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  32.88 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  34.98 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  36.32 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  36.84 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  34.8 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  34.58 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  30.92 
 
 		 240 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  33.17 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  31.74 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  29.95 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  30.41 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  33.65 
 
 		 235 aa  101  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  30.49 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  32.21 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  31.07 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  31.46 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  35.92 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  31.88 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  33.49 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  33.78 
 
 		 256 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  33.18 
 
 		 261 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2131  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  31.47 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  29.36 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  32.58 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  29.7 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  29.7 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  29.7 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  31.71 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1867  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  30.94 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.38 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  29.38 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  29.38 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  29.38 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  29.38 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  29.38 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  29.38 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  29.38 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2616  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  31.19 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1760  GntR domain protein  29.74 
 
 		 277 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 230 aa  92  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  33.33 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  30.32 
 
 		 266 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  29.7 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  27.31 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4212  GntR domain protein  27.31 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  27.31 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000443765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  27.31 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5191  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000012685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1899  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.671252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>