More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4397 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
302 aa  604  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
274 aa  202  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000450076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
319 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
319 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
316 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
281 aa  172  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
288 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
286 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
317 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.443713  normal  0.627473 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
283 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
292 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
286 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  39 
 
 
275 aa  169  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  37.89 
 
 
272 aa  168  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
276 aa  168  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
280 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
279 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
315 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338666  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.75 
 
 
317 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
317 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330167  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
277 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
278 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
299 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
278 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
283 aa  158  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
275 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
293 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
274 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
277 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
296 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
289 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.023138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
289 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
289 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.94 
 
 
275 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0542318  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
289 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
275 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
276 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
275 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 
253 aa  152  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
283 aa  152  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
296 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.76 
 
 
297 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
281 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
282 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
276 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
303 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.96233  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7358  ABC transporter membrane spanning protein  30.77 
 
 
306 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
282 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313327  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
285 aa  148  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.02 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0078  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.48 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.3 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27380  mannitol ABC transporter permease protein  29.75 
 
 
277 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.46 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.462613  normal  0.281344 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
293 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
270 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0838291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
276 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12262  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
281 aa  145  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00417189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
272 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072806  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
269 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2170  carbohydrate ABC transporter permease  32.34 
 
 
275 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148377  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.19 
 
 
280 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
275 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
271 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.44 
 
 
277 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2084  carbohydrate ABC transporter permease  32.34 
 
 
275 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
276 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
275 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
270 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00885853  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
270 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000739004  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.96 
 
 
280 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
277 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.619722 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
277 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2142  transmembrane ABC transporter protein  29.2 
 
 
286 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000847847  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2438  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.52 
 
 
277 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
266 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0321729  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3049  transmembrane ABC transporter protein  29.58 
 
 
276 aa  142  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0698875 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1740  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.18 
 
 
266 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.986821 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
280 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3737  ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 
266 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
276 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0964612  normal  0.170787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
275 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
301 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>