103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0332 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0332  YceI family protein  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01687  YceI like family  27.27 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.740504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3045  YceI family protein  32.11 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  29.29 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  24.81 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  29.69 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  25.58 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  30.7 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  33.04 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  26.52 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  26.67 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  25.19 
 
 		 441 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  32.17 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  32.17 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  29.92 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  27.59 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  25.89 
 
 		 189 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  27.78 
 
 		 177 aa  52  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  28.24 
 
 		 177 aa  51.6  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  26.87 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  26.36 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0602  YceI family protein  26.23 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  31.62 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0685  hypothetical protein  25.41 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  27.07 
 
 		 182 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  34.15 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  29.84 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  24.37 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  25.23 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0470  YceI family protein  22.31 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3579  YceI family protein  25 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.948947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  30.68 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  23.77 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1616  hypothetical protein  23.2 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1611  hypothetical protein  22.4 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  28.41 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  28.45 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  21.6 
 
 		 416 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  22.22 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  24.11 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  27.56 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  25 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0101  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000553926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0157  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00114927  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0247  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186858  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0302  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0539  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0478326  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0635  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000109907  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0751  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000459793  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0834  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000820934  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1221  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000020949  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1383  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000158375  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1477  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136224  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1873  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00916179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2345  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2390  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.082083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3274  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000259909  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3389  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141638  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3833  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4033  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000656142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4083  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0538175  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4095  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00617588  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  28.7 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  30.68 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  25.6 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3382  transposase, IS4 family protein  60.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182437  hitchhiker  0.00538438 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  29.55 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  26.27 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  25.19 
 
 		 285 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  26.62 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  22.3 
 
 		 420 aa  45.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  29.17 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  28.41 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  31.15 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  30.99 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  30.99 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  25 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  29.25 
 
 		 174 aa  45.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3201  YceI family protein  26.67 
 
 		 186 aa  45.1  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.484936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  27.14 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  26.52 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  40.38 
 
 		 355 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  22.73 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  24.29 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  25.6 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  25.76 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  26.55 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  28.83 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  26.67 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  22.32 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  23.46 
 
 		 192 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  29.55 
 
 		 191 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  29.55 
 
 		 191 aa  42  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  29.55 
 
 		 191 aa  42  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  29.55 
 
 		 191 aa  42  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  29.55 
 
 		 191 aa  42  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  29.55 
 
 		 191 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1030  hypothetical protein  20.9 
 
 		 186 aa  42  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.103898  normal  0.0258647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  29.55 
 
 		 191 aa  42  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  29.55 
 
 		 191 aa  42  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>