More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3223 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
325 aa  645    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.738302  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.23 
 
 
356 aa  335  5e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
308 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.14 
 
 
315 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.62 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  39.19 
 
 
306 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
299 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
299 aa  189  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453278  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
298 aa  182  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.2 
 
 
279 aa  182  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.232459 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
286 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728774  normal  0.302995 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
293 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  36.36 
 
 
293 aa  178  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  39.93 
 
 
287 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
293 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  36.3 
 
 
294 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
293 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
311 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
293 aa  176  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  34.35 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
299 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
316 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
306 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
316 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.2607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.03 
 
 
294 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0905  transmembrane permease MsmF  36.99 
 
 
289 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0122469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
335 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
294 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
317 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
294 aa  165  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00013616  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.05 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 
310 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  35.6 
 
 
310 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 
288 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  36.13 
 
 
310 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  35.28 
 
 
310 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
353 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
328 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  35.71 
 
 
293 aa  159  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.69 
 
 
328 aa  159  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
322 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.4 
 
 
314 aa  159  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
323 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000203032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.28 
 
 
310 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
328 aa  159  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  34.95 
 
 
310 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
310 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 
310 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3307  sugar transport system (permease)  33.88 
 
 
325 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
299 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  34.63 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  34.63 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  34.63 
 
 
310 aa  156  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
300 aa  156  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
307 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  34.58 
 
 
307 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.47 
 
 
301 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
302 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
299 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
318 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  32.78 
 
 
318 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
318 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
290 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
299 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
320 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495335  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
319 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00382098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
306 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0935  multiple sugar transport system permease protein  34.52 
 
 
328 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
294 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
338 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254991 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
305 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
320 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
328 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.983189  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  32.43 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
313 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
292 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7172  sugar transport system (permease)  34.28 
 
 
323 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
300 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
295 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.98 
 
 
304 aa  145  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
303 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000249122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.03 
 
 
308 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000461706  normal  0.23331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
318 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
316 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
310 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
308 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.29 
 
 
275 aa  143  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
325 aa  142  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>