44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5227 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5227  hypothetical protein  100 
 
 
1394 aa  2843    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23932  predicted protein  30.34 
 
 
1009 aa  92  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92062  predicted protein  30.31 
 
 
280 aa  80.1  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1504  hypothetical protein  32.53 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.487624  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.05 
 
 
1831 aa  67.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  31.87 
 
 
650 aa  62.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.65 
 
 
1652 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  25.76 
 
 
1766 aa  58.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  25.44 
 
 
1714 aa  53.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.29 
 
 
1161 aa  52.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  22.6 
 
 
516 aa  52  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  26.28 
 
 
1041 aa  52  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  29.93 
 
 
1789 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  23.58 
 
 
1164 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.56 
 
 
1364 aa  50.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.89 
 
 
1161 aa  51.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02950  transcription corepressor, putative  30.91 
 
 
881 aa  50.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414493  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  32.31 
 
 
344 aa  50.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.93 
 
 
1474 aa  49.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.65 
 
 
1443 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06240  negative regulation of gluconeogenesis-related protein, putative  30 
 
 
737 aa  49.3  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  23.71 
 
 
1682 aa  49.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  34.58 
 
 
344 aa  48.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  23.1 
 
 
1858 aa  48.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  29.83 
 
 
1128 aa  48.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02965  cell cycle regulatory protein (Srw1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08280)  28.21 
 
 
592 aa  48.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.76845 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  24.02 
 
 
1737 aa  47.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  30.22 
 
 
1209 aa  47.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.32 
 
 
1039 aa  47.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  23.77 
 
 
1523 aa  47.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  22.67 
 
 
316 aa  47  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.47 
 
 
1217 aa  46.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.18 
 
 
1481 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  21.46 
 
 
1510 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  22.86 
 
 
696 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.17 
 
 
1823 aa  47  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  22.62 
 
 
1661 aa  46.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  22.97 
 
 
1656 aa  46.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  26.32 
 
 
358 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.17 
 
 
1214 aa  46.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.52 
 
 
1357 aa  45.8  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.12 
 
 
1454 aa  45.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_13512  predicted protein  32.65 
 
 
230 aa  45.1  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0186669  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13210  predicted protein  32.65 
 
 
230 aa  45.1  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00422519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>