130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0768 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0768  benzoate transporter  100 
 
 		 397 aa  748    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1661  benzoate transporter  61.62 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000324364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1454  benzoate transporter  58.85 
 
 		 403 aa  346  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0411  putative benzoate transporter protein  51.83 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2805  benzoate transporter  46.97 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2262  benzoate transporter  46.75 
 
 		 410 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.534042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3071  benzoate transporter  45.72 
 
 		 399 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3514  benzoate transporter  55.92 
 
 		 361 aa  288  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4033  benzoate transporter  54.05 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.485429  normal  0.0404711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7276  benzoate transporter  48.94 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3247  benzoate transport protein  44.47 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760281  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3368  Benzoate membrane transport protein  45.62 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0604614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  39.8 
 
 		 398 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  37.8 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  40.42 
 
 		 383 aa  229  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  40.42 
 
 		 647 aa  229  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  40.77 
 
 		 395 aa  225  9e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0805  benzoate transporter  39.63 
 
 		 383 aa  223  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  39.74 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  38.64 
 
 		 392 aa  217  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  38.54 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  38.54 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  38.54 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  38.38 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  38.28 
 
 		 395 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  38.7 
 
 		 395 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  40 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  36.69 
 
 		 396 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2541  benzoate transporter  39.53 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.630125 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  39.84 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2362  benzoate membrane transport protein  38.78 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  40.11 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  36.34 
 
 		 400 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  35.81 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0767  benzoate transporter  40.52 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  35.31 
 
 		 396 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  35.2 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  35.2 
 
 		 398 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  32.16 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1440  benzoate transporter  42.89 
 
 		 381 aa  202  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1556  benzoate transport protein  37.83 
 
 		 387 aa  202  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  36.25 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  36.25 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  38.89 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2091  putative benzoate transporter, BenE  40.23 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  36.32 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  36.25 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  36.25 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  36.25 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  38.54 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  36.08 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  35.99 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  34.69 
 
 		 396 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0679  benzoate transporter  42.97 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  35.48 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  38.06 
 
 		 393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  35.7 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  40.26 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4269  benzoate transporter  37.2 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  34.91 
 
 		 397 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  35.84 
 
 		 394 aa  196  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  36.81 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1144  benzoate membrane transport protein  34.75 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2303  benzoate transporter  33.76 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  36.81 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  36.81 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  36.81 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  36.81 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  36.81 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  36.05 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  36.81 
 
 		 481 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  38.8 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  33.92 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  37.4 
 
 		 392 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  40.57 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4140  benzoate transporter  32.74 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  34.03 
 
 		 404 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1792  benzoate membrane transport protein  34.38 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  32.9 
 
 		 401 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  36.2 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  36.06 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  36.06 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  36.06 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  35.81 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3137  benzoate transporter  33.16 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3707  benzoate transporter  33.77 
 
 		 404 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2035  benzoate transporter  33.77 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  35.29 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  37.63 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  37.63 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2103  benzoate transporter  36.91 
 
 		 403 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  37.37 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1981  benzoate transporter  35.09 
 
 		 388 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2241  benzoate transporter  36.51 
 
 		 407 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.739572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2107  benzoate transporter  31.38 
 
 		 393 aa  177  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.07884  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  35.79 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  38.64 
 
 		 477 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42070  Benzoate membrane transport protein  30.98 
 
 		 406 aa  172  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03444  benzoate transport protein  32.45 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0295  benzoate transporter  30.46 
 
 		 388 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>