133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2035 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2035  benzoate transporter  100 
 
 		 404 aa  774    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3707  benzoate transporter  99.5 
 
 		 404 aa  771    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  95.54 
 
 		 404 aa  713    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  78.3 
 
 		 418 aa  607  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  77.61 
 
 		 413 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2303  benzoate transporter  78.88 
 
 		 421 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3137  benzoate transporter  78.63 
 
 		 410 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4140  benzoate transporter  76.14 
 
 		 411 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1144  benzoate membrane transport protein  77.75 
 
 		 408 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  53.99 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0295  benzoate transporter  49.6 
 
 		 388 aa  346  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4997  benzoate transporter  47.61 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5863  benzoate transporter  47.61 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5243  benzoate transporter  49.33 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3246  benzoate transporter  46.65 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.334236 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5095  benzoate transporter  46.38 
 
 		 400 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149673  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  44.65 
 
 		 402 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2107  benzoate transporter  46.56 
 
 		 393 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.07884  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  44.97 
 
 		 406 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4316  benzoate transporter  46.65 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.860854  hitchhiker  0.000181126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42070  Benzoate membrane transport protein  47.76 
 
 		 406 aa  331  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1369  benzoate transporter  44.92 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00588057  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  44.67 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  46.67 
 
 		 400 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2976  benzoate membrane transport protein  48.53 
 
 		 440 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  44.97 
 
 		 406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  45.84 
 
 		 396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  44.53 
 
 		 405 aa  325  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  46.3 
 
 		 396 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5351  benzoate membrane transport protein  45.25 
 
 		 405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  46.83 
 
 		 396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  45.36 
 
 		 403 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  45.07 
 
 		 481 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  46.56 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  45.07 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  45.07 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  45.07 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  45.07 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  45.07 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  45.07 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  43.01 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  43.01 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  45.08 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  43.01 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  43.01 
 
 		 395 aa  317  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  46.03 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  45.09 
 
 		 403 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  45.36 
 
 		 403 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2960  benzoate membrane transport protein  44.17 
 
 		 399 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  42.74 
 
 		 395 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  44.01 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2103  benzoate transporter  45.74 
 
 		 403 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  43.92 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  44.74 
 
 		 403 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  44.74 
 
 		 403 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  44.74 
 
 		 403 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2702  benzoate transporter  46.74 
 
 		 399 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  44.9 
 
 		 397 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1792  benzoate membrane transport protein  45.07 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  43.28 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  44.65 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3167  benzoate transporter  46.3 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267314  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2548  benzoate transporter  46.03 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  42.82 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  42.82 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  42.82 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  40.57 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2682  benzoate transporter  45.29 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  42.82 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  42.82 
 
 		 422 aa  300  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  42.3 
 
 		 422 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  43.01 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  43 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  44.41 
 
 		 392 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2541  benzoate transporter  41.43 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.630125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2362  benzoate membrane transport protein  43.04 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  41.25 
 
 		 402 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  44.72 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1263  benzoate transporter  41.44 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  41.32 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  42.74 
 
 		 394 aa  282  8.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  42.09 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4269  benzoate transporter  43.01 
 
 		 394 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  43.04 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1783  benzoate transporter  40.11 
 
 		 398 aa  280  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  47.8 
 
 		 477 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  41.4 
 
 		 403 aa  276  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2241  benzoate transporter  44.9 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.739572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  42.93 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1981  benzoate transporter  43.6 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  42.09 
 
 		 392 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  42.09 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  42.09 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  42.13 
 
 		 421 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  35.25 
 
 		 392 aa  249  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  37.6 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  36.46 
 
 		 647 aa  226  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0805  benzoate transporter  37.87 
 
 		 383 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1661  benzoate transporter  39.27 
 
 		 418 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000324364 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03312  benzoate transporter  41.61 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000811175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>