131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3994 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  100 
 
 		 395 aa  756    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03312  benzoate transporter  73.72 
 
 		 332 aa  425  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000811175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  57.49 
 
 		 395 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  57.22 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  57.49 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  57.22 
 
 		 395 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  58.88 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  57.99 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  56.95 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  55.35 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  55.24 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  54.97 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  56.42 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  57.33 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  58.1 
 
 		 403 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  53.83 
 
 		 396 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  54.97 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  54.05 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  56.65 
 
 		 396 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  56.7 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  53.91 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  55.64 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  58.55 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  53.52 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  55.64 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  53.14 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  60.05 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  53.49 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  54.01 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  56.42 
 
 		 386 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  53.23 
 
 		 403 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  54.01 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  54.01 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  53 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  55.35 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  53.23 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1792  benzoate membrane transport protein  54.05 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  53.68 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  52 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  52 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  53.87 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2362  benzoate membrane transport protein  55.35 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  53.87 
 
 		 481 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  53.87 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  53.87 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  53.87 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  53.87 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  53.87 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  52 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  51.73 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  52 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  53 
 
 		 406 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  50.4 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  58.11 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4269  benzoate transporter  51.04 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  49.87 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  51.73 
 
 		 422 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2541  benzoate transporter  53.4 
 
 		 395 aa  364  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.630125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  48.81 
 
 		 401 aa  362  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2103  benzoate transporter  51.82 
 
 		 403 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36671 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  51.2 
 
 		 392 aa  349  5e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1981  benzoate transporter  52.53 
 
 		 388 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  50.26 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  43.64 
 
 		 392 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  51.03 
 
 		 392 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1369  benzoate transporter  46.6 
 
 		 398 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00588057  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  50.77 
 
 		 392 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2241  benzoate transporter  51.47 
 
 		 407 aa  330  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.739572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  50.52 
 
 		 392 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3167  benzoate transporter  48.92 
 
 		 423 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267314  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2548  benzoate transporter  48.92 
 
 		 399 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  45.67 
 
 		 413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2960  benzoate membrane transport protein  45.95 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2682  benzoate transporter  48.66 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2702  benzoate transporter  48.66 
 
 		 399 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  44.53 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  43.3 
 
 		 418 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2107  benzoate transporter  43.19 
 
 		 393 aa  305  6e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.07884  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2303  benzoate transporter  43.46 
 
 		 421 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0295  benzoate transporter  42.3 
 
 		 388 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4997  benzoate transporter  42.97 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5863  benzoate transporter  42.97 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4316  benzoate transporter  42.71 
 
 		 400 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.860854  hitchhiker  0.000181126 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5095  benzoate transporter  42.75 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149673  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3246  benzoate transporter  43.01 
 
 		 400 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.334236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5351  benzoate membrane transport protein  43.49 
 
 		 405 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3707  benzoate transporter  44.01 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4140  benzoate transporter  42.52 
 
 		 411 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2035  benzoate transporter  44.01 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3137  benzoate transporter  43.04 
 
 		 410 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42070  Benzoate membrane transport protein  43.42 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1144  benzoate membrane transport protein  43.46 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2976  benzoate membrane transport protein  44.21 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5243  benzoate transporter  43.42 
 
 		 398 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1556  benzoate transport protein  42.78 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1783  benzoate transporter  38.02 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1742  benzoate transporter  50 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000016088  hitchhiker  2.5530700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1263  benzoate transporter  37.86 
 
 		 409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03444  benzoate transport protein  42.7 
 
 		 396 aa  265  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  43.49 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>