128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1742 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1742  benzoate transporter  100 
 
 		 330 aa  648    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000016088  hitchhiker  2.5530700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  97.85 
 
 		 422 aa  629  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  97.85 
 
 		 422 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  97.62 
 
 		 391 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  97.62 
 
 		 391 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  97.62 
 
 		 391 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  97.62 
 
 		 391 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  72.79 
 
 		 392 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  73.13 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  73.13 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  72.79 
 
 		 392 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1981  benzoate transporter  69.23 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  55.44 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  56.34 
 
 		 392 aa  297  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4269  benzoate transporter  53.72 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  56.08 
 
 		 397 aa  296  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  50 
 
 		 395 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  50.71 
 
 		 395 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  50.71 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  50.71 
 
 		 395 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  50.71 
 
 		 395 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  50.71 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  47.18 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  49.29 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  46.13 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  49.82 
 
 		 402 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  44.26 
 
 		 390 aa  252  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  50 
 
 		 396 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  45.61 
 
 		 392 aa  248  9e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  49.29 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  44.37 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  44.37 
 
 		 396 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  45.2 
 
 		 396 aa  242  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  46.4 
 
 		 477 aa  242  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  44.01 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  43.77 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  49.31 
 
 		 390 aa  238  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1792  benzoate membrane transport protein  43 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  45.42 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  50 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  46.62 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03312  benzoate transporter  45.71 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000811175  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  44.48 
 
 		 402 aa  235  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  45.91 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  47.97 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  43.37 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  47.28 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  42.61 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  44.13 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  44.72 
 
 		 405 aa  225  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  44.72 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  44.72 
 
 		 481 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  44.72 
 
 		 405 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  44.72 
 
 		 405 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  44.72 
 
 		 405 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  44.72 
 
 		 405 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2362  benzoate membrane transport protein  42.86 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2541  benzoate transporter  43 
 
 		 395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.630125 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  45.91 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  45.91 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  45.91 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  45.94 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  44.84 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  44.48 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  43.42 
 
 		 406 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2241  benzoate transporter  45.36 
 
 		 407 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.739572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2960  benzoate membrane transport protein  38.73 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  39.64 
 
 		 401 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3707  benzoate transporter  40.34 
 
 		 404 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2035  benzoate transporter  40 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  40.34 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2682  benzoate transporter  40.21 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3167  benzoate transporter  37.75 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267314  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  45.05 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2702  benzoate transporter  39.15 
 
 		 399 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  36.43 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2548  benzoate transporter  39.15 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2107  benzoate transporter  38.85 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.07884  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1556  benzoate transport protein  38.21 
 
 		 387 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2103  benzoate transporter  42.76 
 
 		 403 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2303  benzoate transporter  35.62 
 
 		 421 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1369  benzoate transporter  37.41 
 
 		 398 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00588057  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42070  Benzoate membrane transport protein  39.57 
 
 		 406 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  35.71 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4316  benzoate transporter  37.77 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.860854  hitchhiker  0.000181126 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5095  benzoate transporter  37.77 
 
 		 400 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149673  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1783  benzoate transporter  35.13 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4997  benzoate transporter  37.41 
 
 		 402 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5863  benzoate transporter  37.41 
 
 		 402 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3246  benzoate transporter  37.77 
 
 		 400 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.334236 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2976  benzoate membrane transport protein  40.29 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1263  benzoate transporter  35.48 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0805  benzoate transporter  37.89 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0295  benzoate transporter  38.93 
 
 		 388 aa  178  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4140  benzoate transporter  35.59 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  38.16 
 
 		 383 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  37.98 
 
 		 647 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5243  benzoate transporter  39.29 
 
 		 398 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3137  benzoate transporter  35.67 
 
 		 410 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1144  benzoate membrane transport protein  35.45 
 
 		 408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>