131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1783 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1263  benzoate transporter  85.32 
 
 
409 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1783  benzoate transporter  100 
 
 
398 aa  788    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2107  benzoate transporter  59.64 
 
 
393 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.07884  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1369  benzoate transporter  59.89 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00588057  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4997  benzoate transporter  56.15 
 
 
402 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5095  benzoate transporter  56.41 
 
 
400 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149673  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5863  benzoate transporter  56.15 
 
 
402 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3246  benzoate transporter  56.67 
 
 
400 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.334236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4316  benzoate transporter  55.96 
 
 
400 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.860854  hitchhiker  0.000181126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2976  benzoate membrane transport protein  57.77 
 
 
440 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42070  Benzoate membrane transport protein  55.15 
 
 
406 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5243  benzoate transporter  57.66 
 
 
398 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5351  benzoate membrane transport protein  59.58 
 
 
405 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  50.64 
 
 
401 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  43.34 
 
 
406 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  43.8 
 
 
396 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0295  benzoate transporter  43.41 
 
 
388 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  41.78 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  41.25 
 
 
402 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2960  benzoate membrane transport protein  43.6 
 
 
399 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2702  benzoate transporter  45.09 
 
 
399 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796248  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  42.56 
 
 
406 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  42.67 
 
 
390 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2548  benzoate transporter  44.03 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  43.34 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  43.31 
 
 
396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  43.57 
 
 
398 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  41.18 
 
 
413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  43.04 
 
 
396 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  41.78 
 
 
405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  41.78 
 
 
405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  41.78 
 
 
405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  41.78 
 
 
405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  41.78 
 
 
405 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  41.78 
 
 
481 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2682  benzoate transporter  43.8 
 
 
405 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  41.99 
 
 
405 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3167  benzoate transporter  43.8 
 
 
423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267314  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  41.8 
 
 
395 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  41.53 
 
 
395 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  41.19 
 
 
403 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  41.21 
 
 
403 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  41.53 
 
 
395 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  41.67 
 
 
397 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4140  benzoate transporter  42.51 
 
 
411 aa  299  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  41.21 
 
 
403 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  41.21 
 
 
403 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  41.27 
 
 
395 aa  299  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  41.21 
 
 
403 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  41.01 
 
 
395 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  40.84 
 
 
403 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1792  benzoate membrane transport protein  42.56 
 
 
396 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2303  benzoate transporter  41.38 
 
 
421 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  42.41 
 
 
398 aa  295  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  38.85 
 
 
400 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  38.02 
 
 
395 aa  295  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  39.05 
 
 
430 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  40.11 
 
 
418 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2103  benzoate transporter  41.47 
 
 
403 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3137  benzoate transporter  41.71 
 
 
410 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1144  benzoate membrane transport protein  41.98 
 
 
408 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  40.64 
 
 
404 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  41.53 
 
 
396 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4269  benzoate transporter  40.53 
 
 
394 aa  286  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  41.04 
 
 
392 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  40.58 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  38.62 
 
 
398 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  42.15 
 
 
386 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2541  benzoate transporter  41.3 
 
 
395 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.630125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3707  benzoate transporter  40.37 
 
 
404 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2035  benzoate transporter  40.11 
 
 
404 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2241  benzoate transporter  41.02 
 
 
407 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.739572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  36.9 
 
 
395 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2362  benzoate membrane transport protein  40.62 
 
 
392 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  40.16 
 
 
421 aa  275  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  37.73 
 
 
395 aa  272  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  36.18 
 
 
402 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  40.76 
 
 
397 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  36.05 
 
 
390 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  36.34 
 
 
403 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  38.24 
 
 
393 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  36.07 
 
 
422 aa  259  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  36.07 
 
 
391 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  36.07 
 
 
391 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  36.07 
 
 
391 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  36.07 
 
 
391 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  36.07 
 
 
422 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  39.56 
 
 
477 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  35.42 
 
 
392 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  34.79 
 
 
392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  38.1 
 
 
392 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  38.36 
 
 
392 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  38.1 
 
 
392 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  38.1 
 
 
392 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1981  benzoate transporter  36.27 
 
 
388 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0805  benzoate transporter  35.28 
 
 
383 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  34.75 
 
 
383 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  35.18 
 
 
647 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1556  benzoate transport protein  36.98 
 
 
387 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03444  benzoate transport protein  35.03 
 
 
396 aa  199  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>