130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0927 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  100 
 
 
395 aa  762    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  79.19 
 
 
402 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  79.38 
 
 
395 aa  596  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  79.19 
 
 
403 aa  591  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  77.1 
 
 
393 aa  577  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  71.47 
 
 
390 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  72.08 
 
 
421 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  56.7 
 
 
395 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  53.28 
 
 
395 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  53.02 
 
 
395 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  53.02 
 
 
395 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  53.28 
 
 
395 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  53.02 
 
 
395 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  52.45 
 
 
406 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  52.7 
 
 
402 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  51.95 
 
 
396 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  51.82 
 
 
398 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  51.55 
 
 
397 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  52.06 
 
 
405 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  52.34 
 
 
396 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  52.34 
 
 
396 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1792  benzoate membrane transport protein  50.91 
 
 
396 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  52.2 
 
 
406 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  53.09 
 
 
403 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  53.09 
 
 
403 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  53.09 
 
 
403 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  51.56 
 
 
396 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  50.64 
 
 
430 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  51.04 
 
 
400 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  52.58 
 
 
403 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  52.58 
 
 
403 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  52.32 
 
 
403 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  51.8 
 
 
396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  51.67 
 
 
398 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  51.16 
 
 
481 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  51.16 
 
 
405 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  51.16 
 
 
405 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  51.16 
 
 
405 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  51.16 
 
 
405 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  51.29 
 
 
405 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  51.16 
 
 
405 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  54.13 
 
 
392 aa  346  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  47.95 
 
 
390 aa  346  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2541  benzoate transporter  50.39 
 
 
395 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.630125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  50 
 
 
394 aa  342  5.999999999999999e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  51.69 
 
 
386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  43.67 
 
 
401 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  45.29 
 
 
398 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2103  benzoate transporter  50.52 
 
 
403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4269  benzoate transporter  49.73 
 
 
394 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  50 
 
 
392 aa  334  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  52.7 
 
 
397 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2362  benzoate membrane transport protein  51.67 
 
 
392 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  54.23 
 
 
477 aa  333  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  47.86 
 
 
422 aa  323  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  47.86 
 
 
391 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  47.86 
 
 
391 aa  322  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  47.86 
 
 
391 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  47.86 
 
 
391 aa  322  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  47.59 
 
 
422 aa  322  8e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0295  benzoate transporter  43.81 
 
 
388 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2241  benzoate transporter  48.39 
 
 
407 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.739572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  48.18 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  39.38 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  42.64 
 
 
418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1369  benzoate transporter  43.16 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00588057  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4140  benzoate transporter  43.08 
 
 
411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2107  benzoate transporter  42.75 
 
 
393 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.07884  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2303  benzoate transporter  43.6 
 
 
421 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  48.18 
 
 
392 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1144  benzoate membrane transport protein  43.44 
 
 
408 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1981  benzoate transporter  46.44 
 
 
388 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  42.22 
 
 
413 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  48.18 
 
 
392 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  43.7 
 
 
404 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42070  Benzoate membrane transport protein  43.26 
 
 
406 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5095  benzoate transporter  42.01 
 
 
400 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149673  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  47.92 
 
 
392 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4997  benzoate transporter  41.03 
 
 
402 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5863  benzoate transporter  41.03 
 
 
402 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3137  benzoate transporter  42.82 
 
 
410 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3246  benzoate transporter  42.01 
 
 
400 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.334236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4316  benzoate transporter  40.98 
 
 
400 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.860854  hitchhiker  0.000181126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2976  benzoate membrane transport protein  43.3 
 
 
440 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5243  benzoate transporter  42.49 
 
 
398 aa  278  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03312  benzoate transporter  52.29 
 
 
332 aa  278  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000811175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5351  benzoate membrane transport protein  42.16 
 
 
405 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2548  benzoate transporter  42.31 
 
 
399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2035  benzoate transporter  41.32 
 
 
404 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3707  benzoate transporter  41.32 
 
 
404 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2682  benzoate transporter  43.33 
 
 
405 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2702  benzoate transporter  43.5 
 
 
399 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796248  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3167  benzoate transporter  43.32 
 
 
423 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267314  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1783  benzoate transporter  37.73 
 
 
398 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2960  benzoate membrane transport protein  40.42 
 
 
399 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1556  benzoate transport protein  40.97 
 
 
387 aa  259  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1263  benzoate transporter  38.96 
 
 
409 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  41.21 
 
 
383 aa  252  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  41.21 
 
 
647 aa  252  8.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2262  benzoate transporter  40.2 
 
 
410 aa  245  9e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.534042 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>