131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1229 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  88.28 
 
 		 403 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  84.24 
 
 		 405 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  93.92 
 
 		 406 aa  729    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  85.93 
 
 		 403 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  85.43 
 
 		 403 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  85.93 
 
 		 403 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  85.22 
 
 		 402 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  85.93 
 
 		 403 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  85.43 
 
 		 403 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  100 
 
 		 406 aa  795    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  83.09 
 
 		 481 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  84.08 
 
 		 405 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  84.08 
 
 		 405 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  84.08 
 
 		 405 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  84.08 
 
 		 405 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2103  benzoate transporter  84.83 
 
 		 403 aa  631  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36671 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  84.08 
 
 		 405 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  84.08 
 
 		 405 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1792  benzoate membrane transport protein  76.09 
 
 		 396 aa  558  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  72.1 
 
 		 400 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  74.04 
 
 		 396 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  74.23 
 
 		 398 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  73.97 
 
 		 396 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  72.46 
 
 		 430 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  73.71 
 
 		 396 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  67.44 
 
 		 396 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  66.93 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2541  benzoate transporter  66.15 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.630125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2362  benzoate membrane transport protein  65.71 
 
 		 392 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  54.45 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  53.65 
 
 		 395 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  53.25 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  54.55 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  51.47 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  51.47 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  51.21 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  53 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  50.94 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  51.21 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  52.59 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  49.74 
 
 		 398 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2241  benzoate transporter  53.8 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.739572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  52.2 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  52.62 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  50.26 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  53.14 
 
 		 392 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  53.89 
 
 		 477 aa  363  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  49.6 
 
 		 386 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  48.54 
 
 		 398 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1369  benzoate transporter  46.48 
 
 		 398 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00588057  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  45.54 
 
 		 413 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  52.47 
 
 		 397 aa  342  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  51.95 
 
 		 421 aa  339  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  45.5 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2107  benzoate transporter  46.19 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.07884  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0295  benzoate transporter  45.81 
 
 		 388 aa  334  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  47 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4269  benzoate transporter  49.61 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  44.85 
 
 		 418 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5095  benzoate transporter  44.53 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149673  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4997  benzoate transporter  44.53 
 
 		 402 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5863  benzoate transporter  44.53 
 
 		 402 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  48.53 
 
 		 392 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  48.94 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4140  benzoate transporter  46.4 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3246  benzoate transporter  44.27 
 
 		 400 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.334236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4316  benzoate transporter  43.77 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.860854  hitchhiker  0.000181126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2976  benzoate membrane transport protein  45.68 
 
 		 440 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2548  benzoate transporter  48.79 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2682  benzoate transporter  49.6 
 
 		 405 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2702  benzoate transporter  48.53 
 
 		 399 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3167  benzoate transporter  46.72 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267314  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2960  benzoate membrane transport protein  46.77 
 
 		 399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2303  benzoate transporter  45.22 
 
 		 421 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42070  Benzoate membrane transport protein  46.17 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3707  benzoate transporter  45.24 
 
 		 404 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3137  benzoate transporter  46.67 
 
 		 410 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2035  benzoate transporter  44.97 
 
 		 404 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  46.38 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5351  benzoate membrane transport protein  45.22 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1263  benzoate transporter  43.98 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  46.11 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  46.11 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  46.11 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  46.11 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  45.84 
 
 		 422 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1144  benzoate membrane transport protein  46.25 
 
 		 408 aa  315  7e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5243  benzoate transporter  45.81 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  44.13 
 
 		 392 aa  312  9e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1783  benzoate transporter  42.56 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1981  benzoate transporter  48.46 
 
 		 388 aa  306  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  44.59 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  45.12 
 
 		 392 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  45.12 
 
 		 392 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  44.85 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03312  benzoate transporter  48.21 
 
 		 332 aa  269  8e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000811175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  38.32 
 
 		 647 aa  246  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  38.27 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0805  benzoate transporter  38.01 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2805  benzoate transporter  41.73 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0218631 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>