131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0963 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  95.04 
 
 
405 aa  708    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  95.29 
 
 
481 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  87.79 
 
 
403 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  100 
 
 
405 aa  784    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  83.71 
 
 
406 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  89.35 
 
 
403 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  86.75 
 
 
403 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  89.35 
 
 
403 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  95.29 
 
 
405 aa  710    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  95.29 
 
 
405 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  95.29 
 
 
405 aa  710    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  95.29 
 
 
405 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  95.29 
 
 
405 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  88 
 
 
402 aa  685    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  89.35 
 
 
403 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  86.5 
 
 
403 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  84.24 
 
 
406 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2103  benzoate transporter  81.59 
 
 
403 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  72.12 
 
 
398 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  70.22 
 
 
400 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  71.61 
 
 
396 aa  544  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  71.61 
 
 
396 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  69.98 
 
 
430 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  71.68 
 
 
396 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1792  benzoate membrane transport protein  70.53 
 
 
396 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  64.38 
 
 
396 aa  510  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  66.49 
 
 
397 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2362  benzoate membrane transport protein  66.23 
 
 
392 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2541  benzoate transporter  64.78 
 
 
395 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.630125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  52.86 
 
 
401 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  54.05 
 
 
395 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  53.87 
 
 
393 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  53.83 
 
 
395 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  53.14 
 
 
402 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  54.78 
 
 
392 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  50 
 
 
395 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  50 
 
 
395 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  49.48 
 
 
395 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  49.74 
 
 
395 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  49.21 
 
 
395 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2241  benzoate transporter  54.62 
 
 
407 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.739572 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  48.42 
 
 
398 aa  361  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  52.74 
 
 
403 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  51.55 
 
 
395 aa  358  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  48.41 
 
 
386 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  53.89 
 
 
477 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  48.16 
 
 
396 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  48.8 
 
 
398 aa  348  9e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  50.91 
 
 
390 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1369  benzoate transporter  47.38 
 
 
398 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00588057  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  46.21 
 
 
413 aa  343  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  48.57 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  50.94 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4269  benzoate transporter  49.35 
 
 
394 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  50 
 
 
394 aa  334  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  46.13 
 
 
404 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  51.55 
 
 
421 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0295  benzoate transporter  44.24 
 
 
388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5351  benzoate membrane transport protein  48.03 
 
 
405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  46.54 
 
 
422 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  44.21 
 
 
418 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2303  benzoate transporter  45.87 
 
 
421 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4140  benzoate transporter  45.07 
 
 
411 aa  322  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  46.54 
 
 
391 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  46.54 
 
 
391 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  46.54 
 
 
391 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  46.28 
 
 
422 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  46.54 
 
 
391 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3167  benzoate transporter  46.06 
 
 
423 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267314  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2960  benzoate membrane transport protein  46.26 
 
 
399 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2107  benzoate transporter  45.14 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.07884  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3137  benzoate transporter  45.1 
 
 
410 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2548  benzoate transporter  47.86 
 
 
399 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4997  benzoate transporter  43.98 
 
 
402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5863  benzoate transporter  43.98 
 
 
402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4316  benzoate transporter  43.72 
 
 
400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.860854  hitchhiker  0.000181126 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5095  benzoate transporter  43.25 
 
 
400 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149673  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3246  benzoate transporter  43.25 
 
 
400 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.334236 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1263  benzoate transporter  42.93 
 
 
409 aa  315  8e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  46.95 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2682  benzoate transporter  47.33 
 
 
405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3707  benzoate transporter  44.8 
 
 
404 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2702  benzoate transporter  46.67 
 
 
399 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796248  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2035  benzoate transporter  44.53 
 
 
404 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1144  benzoate membrane transport protein  45.33 
 
 
408 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42070  Benzoate membrane transport protein  44.85 
 
 
406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5243  benzoate transporter  44.53 
 
 
398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2976  benzoate membrane transport protein  43.03 
 
 
440 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  42.67 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1783  benzoate transporter  41.78 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1981  benzoate transporter  47.68 
 
 
388 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  45.09 
 
 
392 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  45.62 
 
 
392 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  45.62 
 
 
392 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  45.36 
 
 
392 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03312  benzoate transporter  50.84 
 
 
332 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000811175  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  39.73 
 
 
383 aa  248  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  39.73 
 
 
647 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0805  benzoate transporter  38.67 
 
 
383 aa  240  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1742  benzoate transporter  45.42 
 
 
330 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000016088  hitchhiker  2.5530700000000003e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>