131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1555 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  98.98 
 
 
392 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  99.23 
 
 
392 aa  747    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  99.23 
 
 
392 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  100 
 
 
392 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  75.38 
 
 
422 aa  584  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  75.38 
 
 
391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  75.38 
 
 
391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  75.13 
 
 
422 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  75.38 
 
 
391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  75.38 
 
 
391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1981  benzoate transporter  70.54 
 
 
388 aa  508  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1742  benzoate transporter  73.13 
 
 
330 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000016088  hitchhiker  2.5530700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  59.36 
 
 
394 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4269  benzoate transporter  59.95 
 
 
394 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  58.42 
 
 
397 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  54.81 
 
 
392 aa  388  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  51.03 
 
 
395 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  50.52 
 
 
402 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  47.55 
 
 
395 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  48.92 
 
 
395 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  48.92 
 
 
395 aa  341  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  48.65 
 
 
395 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  48.65 
 
 
395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  47.48 
 
 
396 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  47.76 
 
 
398 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  50.64 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  47.34 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  46.42 
 
 
390 aa  326  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  47.07 
 
 
430 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  46.3 
 
 
402 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  48.52 
 
 
396 aa  323  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  46.91 
 
 
395 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  47.91 
 
 
386 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  46.54 
 
 
396 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  46.54 
 
 
396 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  46.28 
 
 
398 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  45.62 
 
 
405 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  48.01 
 
 
390 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  48.18 
 
 
395 aa  315  7e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  48.33 
 
 
393 aa  315  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  47.86 
 
 
392 aa  315  8e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  45.48 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  50.8 
 
 
477 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  46.44 
 
 
406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  47.49 
 
 
403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  44.3 
 
 
398 aa  311  9e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  46.97 
 
 
403 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  46.97 
 
 
403 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  47.09 
 
 
403 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  46.7 
 
 
403 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  46.7 
 
 
403 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  45.48 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  45.48 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  45.48 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  45.48 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  45.48 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  45.48 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  45.48 
 
 
481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1792  benzoate membrane transport protein  46.03 
 
 
396 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  45.12 
 
 
406 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  42.36 
 
 
413 aa  300  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  41.78 
 
 
418 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  44.3 
 
 
397 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  46.45 
 
 
421 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4140  benzoate transporter  42.28 
 
 
411 aa  288  9e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  41.51 
 
 
401 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2303  benzoate transporter  42.03 
 
 
421 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  42.6 
 
 
404 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4316  benzoate transporter  40.37 
 
 
400 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.860854  hitchhiker  0.000181126 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1369  benzoate transporter  42.37 
 
 
398 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00588057  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  38.9 
 
 
392 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5095  benzoate transporter  40.85 
 
 
400 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149673  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2241  benzoate transporter  46.49 
 
 
407 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.739572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3246  benzoate transporter  40.85 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.334236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2103  benzoate transporter  45.12 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2541  benzoate transporter  42.93 
 
 
395 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.630125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2362  benzoate membrane transport protein  44.42 
 
 
392 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3137  benzoate transporter  42.04 
 
 
410 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3707  benzoate transporter  42.09 
 
 
404 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2035  benzoate transporter  42.09 
 
 
404 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42070  Benzoate membrane transport protein  41.47 
 
 
406 aa  278  9e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2107  benzoate transporter  40.26 
 
 
393 aa  278  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.07884  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4997  benzoate transporter  39.89 
 
 
402 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5863  benzoate transporter  39.89 
 
 
402 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5243  benzoate transporter  42.44 
 
 
398 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5351  benzoate membrane transport protein  40.16 
 
 
405 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2976  benzoate membrane transport protein  40.9 
 
 
440 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1144  benzoate membrane transport protein  41.25 
 
 
408 aa  269  8e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0295  benzoate transporter  40.96 
 
 
388 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0805  benzoate transporter  40.84 
 
 
383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1263  benzoate transporter  39.79 
 
 
409 aa  251  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  40.31 
 
 
383 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  40.31 
 
 
647 aa  245  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1783  benzoate transporter  38.36 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03312  benzoate transporter  47.18 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000811175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2960  benzoate membrane transport protein  37.81 
 
 
399 aa  243  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3167  benzoate transporter  39.18 
 
 
423 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267314  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2702  benzoate transporter  39.13 
 
 
399 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796248  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2548  benzoate transporter  39.45 
 
 
399 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2682  benzoate transporter  39.4 
 
 
405 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>