131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1820 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  100 
 
 		 398 aa  776    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1792  benzoate membrane transport protein  88.86 
 
 		 396 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  99.49 
 
 		 396 aa  770    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  98.48 
 
 		 396 aa  765    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  96.46 
 
 		 396 aa  729    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  80.76 
 
 		 397 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  75.75 
 
 		 430 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  75.25 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  75 
 
 		 406 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  73.47 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  73.58 
 
 		 402 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  72.12 
 
 		 405 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  74.23 
 
 		 406 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  73.58 
 
 		 403 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  73.83 
 
 		 403 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  73.83 
 
 		 403 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  73.83 
 
 		 403 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  73.06 
 
 		 403 aa  544  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  72.54 
 
 		 403 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  71.79 
 
 		 405 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  71.79 
 
 		 405 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  71.79 
 
 		 405 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  71.79 
 
 		 405 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  71.79 
 
 		 405 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  71.79 
 
 		 405 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  71.79 
 
 		 481 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2103  benzoate transporter  70.81 
 
 		 403 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2362  benzoate membrane transport protein  66.58 
 
 		 392 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2541  benzoate transporter  64.71 
 
 		 395 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.630125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  54.97 
 
 		 395 aa  411  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  54.74 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  54.47 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  54.74 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  54.47 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  54.2 
 
 		 395 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  53.45 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  53.93 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  50.52 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  53.98 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  52.07 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  53.95 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  52.85 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  52.55 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  51.82 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  51.55 
 
 		 390 aa  362  9e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1369  benzoate transporter  46.6 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00588057  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  49.34 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  48.97 
 
 		 390 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2241  benzoate transporter  52.7 
 
 		 407 aa  349  5e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.739572 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  51.04 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  51.47 
 
 		 477 aa  341  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  46.04 
 
 		 413 aa  339  4e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  52.06 
 
 		 421 aa  339  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  49.07 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4140  benzoate transporter  46.7 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4269  benzoate transporter  49.08 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3167  benzoate transporter  48.53 
 
 		 423 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267314  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  45.91 
 
 		 418 aa  331  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2303  benzoate transporter  45.09 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  46.81 
 
 		 422 aa  330  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2960  benzoate membrane transport protein  46.6 
 
 		 399 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2548  benzoate transporter  49.06 
 
 		 399 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0295  benzoate transporter  45.29 
 
 		 388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2107  benzoate transporter  45.67 
 
 		 393 aa  329  7e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.07884  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  46.67 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  46.54 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  46.54 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  46.54 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  46.28 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  49.73 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  46.54 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1144  benzoate membrane transport protein  47.09 
 
 		 408 aa  326  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  49.87 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2682  benzoate transporter  48.53 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5351  benzoate membrane transport protein  47.11 
 
 		 405 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2702  benzoate transporter  47.45 
 
 		 399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796248  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  43.01 
 
 		 392 aa  319  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3707  benzoate transporter  46.13 
 
 		 404 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2035  benzoate transporter  46.13 
 
 		 404 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5095  benzoate transporter  43.72 
 
 		 400 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149673  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3137  benzoate transporter  46.93 
 
 		 410 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3246  benzoate transporter  43.72 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.334236 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42070  Benzoate membrane transport protein  44.76 
 
 		 406 aa  312  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4997  benzoate transporter  43.08 
 
 		 402 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5863  benzoate transporter  43.08 
 
 		 402 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4316  benzoate transporter  42.93 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.860854  hitchhiker  0.000181126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  46.01 
 
 		 392 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1263  benzoate transporter  44.76 
 
 		 409 aa  306  6e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5243  benzoate transporter  43.98 
 
 		 398 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  46.54 
 
 		 392 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2976  benzoate membrane transport protein  43.98 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  46.28 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1783  benzoate transporter  43.57 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1981  benzoate transporter  45.62 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  46.28 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03312  benzoate transporter  52.04 
 
 		 332 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000811175  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  43.6 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  43.6 
 
 		 647 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0805  benzoate transporter  42.56 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1556  benzoate transport protein  41.03 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>