130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1454 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1454  benzoate transporter  100 
 
 		 403 aa  743    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1661  benzoate transporter  60.47 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000324364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0768  benzoate transporter  58.85 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3514  benzoate transporter  59.78 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0411  putative benzoate transporter protein  54.21 
 
 		 427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2805  benzoate transporter  50 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2262  benzoate transporter  48.23 
 
 		 410 aa  312  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.534042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3071  benzoate transporter  49.86 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4033  benzoate transporter  56.07 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.485429  normal  0.0404711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3247  benzoate transport protein  45.38 
 
 		 394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7276  benzoate transporter  49.87 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3368  Benzoate membrane transport protein  50 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0604614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  38.97 
 
 		 430 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  41.1 
 
 		 392 aa  245  8e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  38.46 
 
 		 400 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  40.37 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  38.34 
 
 		 396 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0805  benzoate transporter  41.87 
 
 		 383 aa  239  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  37.44 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  39.26 
 
 		 406 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  40.72 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  42.22 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  42.4 
 
 		 383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  42.4 
 
 		 647 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  38.36 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  38.64 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  39.03 
 
 		 405 aa  235  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  38.46 
 
 		 396 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  41.58 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  38.64 
 
 		 396 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  39.53 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  40.42 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  39.21 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  38.64 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  40.42 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  40.42 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1792  benzoate membrane transport protein  39.14 
 
 		 396 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  40.05 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  39.42 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  39.42 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  39.42 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  39.42 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  39.42 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  39.42 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  39.42 
 
 		 481 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  35.39 
 
 		 401 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  36.41 
 
 		 397 aa  225  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4140  benzoate transporter  36.2 
 
 		 411 aa  225  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  39.05 
 
 		 403 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  39.21 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  39.21 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  39.21 
 
 		 403 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  39.21 
 
 		 403 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  38.68 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  41.88 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  39.35 
 
 		 398 aa  222  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2303  benzoate transporter  36.76 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  39.95 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2103  benzoate transporter  40.36 
 
 		 403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  40.85 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  37.5 
 
 		 422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  37.5 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  37.5 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  37.5 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  42.08 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  37.23 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  37.5 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2541  benzoate transporter  39.21 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.630125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1144  benzoate membrane transport protein  36.65 
 
 		 408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  34.55 
 
 		 418 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  39.47 
 
 		 398 aa  212  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  39.37 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  34.88 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0767  benzoate transporter  40.47 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  32.43 
 
 		 392 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  40.73 
 
 		 392 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2362  benzoate membrane transport protein  39.05 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0679  benzoate transporter  43.01 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1556  benzoate transport protein  35.68 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03444  benzoate transport protein  34.85 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2091  putative benzoate transporter, BenE  40.18 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3137  benzoate transporter  35.38 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  39.47 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1981  benzoate transporter  38.79 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3707  benzoate transporter  34.63 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2035  benzoate transporter  34.63 
 
 		 404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  40.99 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  38.87 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  40.99 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1440  benzoate transporter  44 
 
 		 381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  37.91 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  40.73 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  42.39 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4316  benzoate transporter  33.42 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.860854  hitchhiker  0.000181126 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5095  benzoate transporter  33.51 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149673  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3246  benzoate transporter  33.77 
 
 		 400 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.334236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  36.07 
 
 		 394 aa  192  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2976  benzoate membrane transport protein  36.49 
 
 		 440 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2241  benzoate transporter  36.99 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.739572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  39.45 
 
 		 477 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>