130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3247 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3247  benzoate transport protein  100 
 
 		 394 aa  751    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2805  benzoate transporter  70.8 
 
 		 399 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3071  benzoate transporter  70.32 
 
 		 399 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2262  benzoate transporter  68.54 
 
 		 410 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.534042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0411  putative benzoate transporter protein  51.92 
 
 		 427 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1661  benzoate transporter  45.24 
 
 		 418 aa  272  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000324364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0768  benzoate transporter  44.47 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7276  benzoate transporter  45.57 
 
 		 434 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3368  Benzoate membrane transport protein  44.6 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0604614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1454  benzoate transporter  45.38 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  38.97 
 
 		 396 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  41.21 
 
 		 402 aa  245  9e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  39.9 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  39.64 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  39.14 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  40.4 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  38.75 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  40.37 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  40.74 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  39.45 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  40.92 
 
 		 395 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  38.02 
 
 		 396 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  39.39 
 
 		 395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  37.5 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  37.53 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  37.27 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  39.75 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  39.6 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  38.86 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  40.65 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  40.38 
 
 		 395 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  40.31 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2362  benzoate membrane transport protein  39.64 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  41.78 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  40.38 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  40.31 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  40.31 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  40.31 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  40.31 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  40.21 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  40.31 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  40.81 
 
 		 395 aa  230  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  38.29 
 
 		 422 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  40.31 
 
 		 481 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  40.79 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3514  benzoate transporter  45 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4033  benzoate transporter  44.96 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.485429  normal  0.0404711 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  37.78 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  38.04 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  38.04 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  38.04 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  38.04 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  41.93 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  37.56 
 
 		 394 aa  226  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2541  benzoate transporter  39.11 
 
 		 395 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.630125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  39.64 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  41.29 
 
 		 386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  38.19 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  38.89 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  38.38 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1792  benzoate membrane transport protein  38.02 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  39.09 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  39.09 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  39.09 
 
 		 403 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  39.13 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1981  benzoate transporter  41.73 
 
 		 388 aa  217  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4269  benzoate transporter  38.58 
 
 		 394 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  41.22 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  37.01 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2103  benzoate transporter  37.88 
 
 		 403 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  41.22 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  37.2 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  41.22 
 
 		 392 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  35.61 
 
 		 390 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  37.3 
 
 		 647 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0295  benzoate transporter  38.4 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  40.96 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  37.67 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  35.92 
 
 		 413 aa  208  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  34.74 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0679  benzoate transporter  40.43 
 
 		 381 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2548  benzoate transporter  38.52 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  37.3 
 
 		 397 aa  206  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3167  benzoate transporter  37.99 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267314  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5095  benzoate transporter  33.59 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149673  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  39.58 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2241  benzoate transporter  36.9 
 
 		 407 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.739572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2682  benzoate transporter  37.7 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0805  benzoate transporter  35.26 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2091  putative benzoate transporter, BenE  39.2 
 
 		 381 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0767  benzoate transporter  39.2 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3246  benzoate transporter  33.59 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.334236 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42070  Benzoate membrane transport protein  34.72 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4997  benzoate transporter  34.9 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5863  benzoate transporter  34.9 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4316  benzoate transporter  34.34 
 
 		 400 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.860854  hitchhiker  0.000181126 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2107  benzoate transporter  35.31 
 
 		 393 aa  199  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.07884  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2702  benzoate transporter  37.17 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.796248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  35.41 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  40.05 
 
 		 477 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>