130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3368 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3368  Benzoate membrane transport protein  100 
 
 		 393 aa  707    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0604614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2262  benzoate transporter  45.76 
 
 		 410 aa  275  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.534042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0411  putative benzoate transporter protein  47.97 
 
 		 427 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2805  benzoate transporter  45.81 
 
 		 399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3247  benzoate transport protein  44.91 
 
 		 394 aa  263  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1454  benzoate transporter  49.35 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3071  benzoate transporter  44.99 
 
 		 399 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0768  benzoate transporter  45.41 
 
 		 397 aa  249  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1661  benzoate transporter  47 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000324364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7276  benzoate transporter  44.03 
 
 		 434 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3514  benzoate transporter  44.48 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2115  benzoate transport protein, putative  38.46 
 
 		 383 aa  208  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.63913  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2678  benzoate transporter  37.2 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  38.46 
 
 		 647 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4033  benzoate transporter  47.53 
 
 		 400 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.485429  normal  0.0404711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3994  benzoate transporter  41.39 
 
 		 395 aa  206  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000979992  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4540  benzoate transporter  42.78 
 
 		 395 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0805  benzoate transporter  37.67 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3891  benzoate transporter  37.5 
 
 		 396 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1820  benzoate transporter  37.23 
 
 		 398 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1398  benzoate transporter  36.97 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0963  benzoate transport protein  39.57 
 
 		 405 aa  199  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1428  benzoate transporter  36.22 
 
 		 396 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3908  benzoate transporter  37.37 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00157906  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0927  benzoate transporter  39.27 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0324  benzoate transporter  37.9 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000364152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1328  benzoate transport protein  39.08 
 
 		 481 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0713293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1014  benzoate transporter  38.58 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0851  benzoate transporter  38.58 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1168  benzoate transporter  38.58 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0297  benzoate transporter  38.58 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0328  benzoate transporter  38.34 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1938  benzoate transport protein  38.58 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3257  benzoate transporter  38.46 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00676766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1176  benzoate transporter  39.19 
 
 		 405 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0329  benzoate transporter  38.07 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000780494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0425  benzoate transporter  38.07 
 
 		 395 aa  192  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0322  benzoate transporter  38.07 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000013011  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0767  benzoate transporter  41.83 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5995  benzoate transporter  39.69 
 
 		 393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202849 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3317  benzoate membrane transport protein  37.47 
 
 		 406 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2485  benzoate transporter  38.24 
 
 		 392 aa  189  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0546857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0943  benzoate transporter  36.86 
 
 		 402 aa  189  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2091  putative benzoate transporter, BenE  41.55 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1839  benzoate membrane transport protein  36.36 
 
 		 397 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.25228  normal  0.411896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0629  benzoate transporter  35.01 
 
 		 398 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2321  benzoate transporter  34.45 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43160  putative transporter  36.29 
 
 		 400 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.243206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3699  benzoate transporter  38.06 
 
 		 398 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00161934  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1662  benzoate transporter  31.51 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0679  benzoate transporter  41.62 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0320  benzoate transporter  40 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3621  putative transporter  36.44 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0431  benzoate transporter  38.97 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586868  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2541  benzoate transporter  38.22 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.630125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1229  benzoate transporter  35.92 
 
 		 406 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.803319  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0985  benzoate transporter  35.37 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0325  benzoate transporter  38.16 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.072313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1440  benzoate transporter  42.82 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  34.76 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2316  benzoate membrane transport protein  31.95 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.688329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5676  benzoate membrane transport protein  35.94 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2373  benzoate transporter  36.2 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1792  benzoate membrane transport protein  34.69 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  34.76 
 
 		 391 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  34.76 
 
 		 391 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  34.76 
 
 		 391 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  34.49 
 
 		 422 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  34.76 
 
 		 391 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2253  benzoate transporter  35.94 
 
 		 403 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1722  benzoate transporter  36.2 
 
 		 403 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.982368  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2334  benzoate transporter  36.2 
 
 		 403 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  35.75 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2362  benzoate membrane transport protein  38.2 
 
 		 392 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2230  benzoate transporter  36.74 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1567  benzoate transporter  35.39 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2357  benzoate transporter  36.03 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2103  benzoate transporter  37.6 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3526  benzoate transporter  41.01 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0179  benzoate transporter  37.77 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3710  benzoate transporter  34.04 
 
 		 418 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4269  benzoate transporter  34.42 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4590  benzoate transporter  33.69 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1641  benzoate transporter  39.08 
 
 		 392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0221313  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0295  benzoate transporter  31.76 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4140  benzoate transporter  31.48 
 
 		 411 aa  162  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  36.01 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  35.75 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2303  benzoate transporter  32.13 
 
 		 421 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5095  benzoate transporter  31.69 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149673  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1736  benzoate transporter  35.49 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2107  benzoate transporter  32.83 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.07884  normal  0.334527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3137  benzoate transporter  32.56 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2035  benzoate transporter  34.58 
 
 		 404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4316  benzoate transporter  33.23 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.860854  hitchhiker  0.000181126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4997  benzoate transporter  33.44 
 
 		 402 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5863  benzoate transporter  33.44 
 
 		 402 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3707  benzoate transporter  34.58 
 
 		 404 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5243  benzoate transporter  32 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3246  benzoate transporter  31.17 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.334236 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>