More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1714 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0824  amidohydrolase  76.35 
 
 
389 aa  643    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0305704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1714  amidohydrolase  100 
 
 
389 aa  801    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0436  amidohydrolase amhX  48.22 
 
 
371 aa  361  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0389  amidohydrolase amhX  48.77 
 
 
371 aa  360  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0436  amidohydrolase amhX  47.95 
 
 
371 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4929  amidohydrolase amhX  49.04 
 
 
371 aa  359  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0327  amidohydrolase amhX  48.22 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0867486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0342  amidohydrolase amhX  48.22 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0314  amidohydrolase  48.22 
 
 
371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0170762  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0311  amidohydrolase  47.67 
 
 
371 aa  354  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0374  amidohydrolase amhX  47.67 
 
 
371 aa  352  5e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0322  amidohydrolase  46.3 
 
 
371 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0781  amidohydrolase  39.84 
 
 
369 aa  273  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222793 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2632  amidohydrolase  40.39 
 
 
367 aa  260  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  33.76 
 
 
395 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  34.32 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  34.32 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  33.42 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  33.6 
 
 
395 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  35.47 
 
 
385 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  30.98 
 
 
420 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  33.69 
 
 
396 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0175  amidohydrolase  34.76 
 
 
386 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  31.05 
 
 
392 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  29.8 
 
 
398 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  29.8 
 
 
398 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.38 
 
 
381 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  33.07 
 
 
396 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  30.43 
 
 
395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4183  amidohydrolase  33.87 
 
 
385 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3992  amidohydrolase  33.6 
 
 
385 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  31 
 
 
381 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  31.47 
 
 
379 aa  152  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  30.29 
 
 
396 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  29.54 
 
 
386 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  30.18 
 
 
381 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  30.51 
 
 
400 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0594  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  29.35 
 
 
381 aa  149  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00422123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  31.87 
 
 
425 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  31.54 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  30.43 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  32.98 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1761  amidohydrolase  28.9 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  32.8 
 
 
393 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  30.29 
 
 
395 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  29.9 
 
 
381 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  32.41 
 
 
387 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  30 
 
 
394 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  29.97 
 
 
394 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4375  amidohydrolase  29.82 
 
 
415 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0113  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.38 
 
 
388 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  32.84 
 
 
440 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  31.33 
 
 
389 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  33.25 
 
 
392 aa  143  6e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  30.59 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  31.33 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  28.95 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  31.64 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  32.23 
 
 
394 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.6 
 
 
391 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1358  amidohydrolase  30.47 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.624162  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.85 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  34.44 
 
 
393 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  30.47 
 
 
388 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13725  predicted protein  30.97 
 
 
397 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.829613  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  31.82 
 
 
394 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4907  amidohydrolase  34.8 
 
 
394 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  28.98 
 
 
392 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0591  amidohydrolase  27.5 
 
 
405 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  31.82 
 
 
406 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  30.38 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  34.24 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  30.91 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  30.1 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  30.34 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  32.43 
 
 
400 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  30.85 
 
 
391 aa  136  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  30.81 
 
 
391 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  33.42 
 
 
396 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6414  amidohydrolase  29.57 
 
 
423 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.820069  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  30.4 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  31.29 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  27.25 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1206  amidohydrolase  30.67 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127649 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31131  predicted protein  30.39 
 
 
443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  30.98 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  33.42 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  32.42 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  31.51 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  33.42 
 
 
389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  31.18 
 
 
412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3967  amidohydrolase  34.01 
 
 
387 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105311  normal  0.023009 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  30.15 
 
 
391 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  30.85 
 
 
453 aa  133  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  30.19 
 
 
430 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  31.27 
 
 
393 aa  132  9e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  30.31 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  31.72 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  30.65 
 
 
397 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  33.07 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>