More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1532 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
269 aa  534  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0324  spermidine/putrescine transport system permease protein  78.24 
 
 
263 aa  417  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000555031  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.22 
 
 
268 aa  336  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1495  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  61.57 
 
 
264 aa  322  3e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1110  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  58.98 
 
 
264 aa  314  7e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0192  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  56.83 
 
 
272 aa  311  6.999999999999999e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1285  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  58.65 
 
 
262 aa  308  5e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0607855  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0631  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  56.37 
 
 
272 aa  293  2e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000147089  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.14 
 
 
265 aa  290  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00769125  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.14 
 
 
265 aa  290  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000544775  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0687  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  50.38 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1291  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  52.43 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.76 
 
 
263 aa  264  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000049585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  36.09 
 
 
281 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2224  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  35.71 
 
 
281 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1038  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.25 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702638  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0871  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  40.98 
 
 
284 aa  169  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
285 aa  169  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000172169  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2001  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.49 
 
 
285 aa  169  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1245  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.49 
 
 
285 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.332009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2478  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.49 
 
 
285 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165165  normal  0.578338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01123  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.49 
 
 
275 aa  168  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.49 
 
 
287 aa  168  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1566  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.49 
 
 
287 aa  168  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000236366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01131  hypothetical protein  38.49 
 
 
275 aa  168  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1303  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.49 
 
 
287 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
275 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00131219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00480798  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1326  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.94 
 
 
287 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0226525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1861  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.71 
 
 
286 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1342  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.94 
 
 
287 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.377668 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1304  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.94 
 
 
287 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1959  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.94 
 
 
277 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448664  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2141  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.94 
 
 
287 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.25 
 
 
286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003482  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotB  36.25 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000668861  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1142  hypothetical protein  37.93 
 
 
282 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1147  hypothetical protein  37.93 
 
 
282 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
295 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1638  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.11 
 
 
285 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17630  polyamine transport protein PotB  36.55 
 
 
297 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2146  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.65 
 
 
286 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
287 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18822  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0661  putrescine transport system permease protein PotH  34.82 
 
 
267 aa  159  6e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.95996  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1533  polyamine transport protein PotB  36.55 
 
 
297 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.8542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
285 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4398  putrescine ABC transporter subunit inner membrane protein  37.34 
 
 
338 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.271562 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1581  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.66 
 
 
285 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
269 aa  156  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3671  polyamine ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1158  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.86 
 
 
286 aa  155  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000395482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
293 aa  155  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282728  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
301 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
293 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
287 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0521412  hitchhiker  0.0000000382912 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
322 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 
278 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1802  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  35.51 
 
 
291 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11898  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.069408  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000222411  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
295 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0981  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.79 
 
 
299 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
301 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378424  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
295 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
317 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1200  spermidine/putrescine ABC transporter permease  31.6 
 
 
282 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1338  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
282 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4006  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
282 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  hitchhiker  0.00000000961653 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1298  spermidine/putrescine ABC transporter permease  31.6 
 
 
282 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1542  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.41 
 
 
281 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1599  spermidine/putrescine transport system permease protein  34.57 
 
 
293 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120621  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04240  putative permease of ABC transporter  39.32 
 
 
309 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
308 aa  143  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130981  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2285  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.29 
 
 
319 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
284 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125571  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1011  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.89 
 
 
289 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.263438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.2 
 
 
267 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
302 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4862  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.68 
 
 
306 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
262 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
305 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181159  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
262 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1440  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
282 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00199938  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
306 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
306 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
326 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
303 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
303 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
326 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 
326 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1180  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  31.58 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00976508  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1376  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>