210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2010 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2010  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  931    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347959  normal  0.266903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2301  hypothetical protein  39.5 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2348  hypothetical protein  39.5 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.17719  normal  0.440051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2340  hypothetical protein  39.5 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2604  hypothetical protein  36.3 
 
 		 298 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3790  hypothetical protein  36.65 
 
 		 290 aa  183  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4036  acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  28.92 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  26.06 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  27.43 
 
 		 293 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  26.39 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  27.14 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  27.17 
 
 		 289 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  28.63 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  27.06 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  26.38 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  30.9 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  25.98 
 
 		 289 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  29 
 
 		 292 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  25.98 
 
 		 289 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  29.08 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  25.58 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1035  palmitoyl-CoA hydrolase  27.74 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3978  Acyl-CoA thioesterase-like  22.78 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  29.13 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  27.17 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  26.27 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  28.02 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  25.49 
 
 		 289 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  29.21 
 
 		 310 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  26.44 
 
 		 289 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  26.32 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1022  acyl-CoA thioesterase  25.47 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  31.19 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  25.49 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  26.74 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0296  palmitoyl-CoA hydrolase  26.69 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.707946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  25.49 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  28.47 
 
 		 288 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  29.12 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  25.68 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  26.95 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  26.64 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  26.48 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  24.6 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  25.78 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  25.98 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0935  acyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  25.62 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  25.84 
 
 		 300 aa  63.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  25.09 
 
 		 292 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  25.77 
 
 		 286 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  26.95 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  25.77 
 
 		 286 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  25.77 
 
 		 286 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  25.82 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  25.77 
 
 		 286 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  25.77 
 
 		 286 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2489  Choloyl-CoA hydrolase  25.87 
 
 		 296 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1097  acyl-CoA thioesterase  25.98 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.157874  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  25.71 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3210  Choloyl-CoA hydrolase  26.17 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  26.25 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  26.25 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  24.8 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2638  Palmitoyl-CoA hydrolase  25.76 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  0.433426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  25.44 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  26.24 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  28.89 
 
 		 120 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  26.25 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  26.25 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  28.46 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  28.24 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  25.51 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  26.64 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  26.64 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  26.64 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  26.46 
 
 		 287 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  25.58 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  25.58 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  26.64 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  25.48 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  25.78 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  25.19 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  29.51 
 
 		 121 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  25.58 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  26.29 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  26.92 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2732  palmitoyl-CoA hydrolase  22.81 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0611615 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  25.87 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>