180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4036 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4036  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 		 288 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2604  hypothetical protein  35.8 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2301  hypothetical protein  36.47 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2348  hypothetical protein  36.47 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.17719  normal  0.440051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2340  hypothetical protein  36.47 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3790  hypothetical protein  33.58 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2010  hypothetical protein  34.51 
 
 		 461 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347959  normal  0.266903 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  29.35 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  28.22 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  29.33 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  29.66 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  28.87 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  28.03 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  28.89 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  28.57 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  27.84 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2248  palmitoyl-CoA hydrolase  32.05 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.745414  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  29.48 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  30.66 
 
 		 314 aa  99  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  29.27 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  29.93 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  30.1 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  28.47 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  29.27 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  29.02 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1097  acyl-CoA thioesterase  27.74 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.157874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  29.76 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  26.99 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  28.87 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  28.91 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  26.92 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  27.4 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  25.91 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  29.24 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  32.86 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2907  acyl-CoA thioesterase  29.9 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121085  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  29.79 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  26.76 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  30.18 
 
 		 303 aa  92.8  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  29.24 
 
 		 289 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  25.7 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  28.88 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  28.52 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  28.28 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  29.39 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  26.48 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  26.64 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  28.22 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  28.87 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  27.46 
 
 		 289 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  28.67 
 
 		 292 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  26.03 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1929  Choloyl-CoA hydrolase  30.85 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107888  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  28.52 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  28.12 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  27.84 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  26.21 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2732  palmitoyl-CoA hydrolase  27.24 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0611615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  30.24 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  26.55 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  25.86 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  26.18 
 
 		 305 aa  86.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0166  palmitoyl-CoA hydrolase  27.49 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00441126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  25.36 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  30.8 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  29.5 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  28.47 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  27.4 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  27.4 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  27.4 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  27.4 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  27.4 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  27.17 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  28.26 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  28.26 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  28.26 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  29.82 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  29.82 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  29.82 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  28.26 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  28.26 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  28.26 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  28.26 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  28.26 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  28.26 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  25.95 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  28.19 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2297  acyl-CoA thioesterase  27.54 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  30.94 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  29.41 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  27.5 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  26.3 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  29.23 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  28.37 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  29.23 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0296  palmitoyl-CoA hydrolase  30.07 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.707946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  29.23 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  29.47 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  27.51 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  29.23 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>