176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2604 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2604  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440159  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3790  hypothetical protein  91.96 
 
 
290 aa  543  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2301  hypothetical protein  82.21 
 
 
297 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2348  hypothetical protein  82.21 
 
 
297 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.17719  normal  0.440051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2340  hypothetical protein  82.21 
 
 
297 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2010  hypothetical protein  36.3 
 
 
461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347959  normal  0.266903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4036  acyl-CoA thioesterase  35.71 
 
 
288 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  29.18 
 
 
277 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  27.97 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  28.67 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  29.83 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  28.89 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  30.51 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  27.87 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  28.81 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  28.35 
 
 
288 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  28.35 
 
 
288 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  30.03 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  27.87 
 
 
289 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  26.3 
 
 
285 aa  89.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  29.07 
 
 
290 aa  89  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  27.97 
 
 
288 aa  89  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  28.97 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  29.64 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  26.07 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  27.46 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  28.23 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  30.27 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  30.5 
 
 
289 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  28.14 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  28.12 
 
 
288 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  28.12 
 
 
288 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  28.12 
 
 
288 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  28.12 
 
 
288 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  27.08 
 
 
286 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  28.74 
 
 
295 aa  87  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  27.08 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  27.08 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  30.5 
 
 
289 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  27.97 
 
 
288 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  29.73 
 
 
289 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  30.5 
 
 
289 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  27.97 
 
 
289 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  26.12 
 
 
284 aa  85.9  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  25.78 
 
 
311 aa  85.5  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  28.77 
 
 
318 aa  85.5  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  27.73 
 
 
288 aa  85.5  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  28.79 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  27.06 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  27.8 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  27.82 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  25.87 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  27.91 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  25.78 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  27.84 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  27.84 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  28.38 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  27.34 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  27.27 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  26.99 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  27.03 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  27.34 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  27.52 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  27.52 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  27.52 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  27.03 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2907  acyl-CoA thioesterase  27.66 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121085  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  27.52 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  27.03 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  28.08 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  26.74 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  27.21 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  27.31 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  24.76 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  27.43 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  27.69 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  28.08 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  29.12 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  25.17 
 
 
300 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  24.91 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  27 
 
 
294 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  27.51 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  27.62 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  26.95 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  24.4 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0306  acyl-CoA thioesterase  29.5 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  25.97 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  25.97 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  25.97 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  25.97 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  25.97 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  26.67 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  25.97 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  25.97 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  25.97 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  25.97 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1270  Choloyl-CoA hydrolase  27.34 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.248751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  26.56 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  25.67 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  25.17 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>