174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2301 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2301  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2348  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.17719  normal  0.440051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2340  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2604  hypothetical protein  82.21 
 
 		 298 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3790  hypothetical protein  81.18 
 
 		 290 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2010  hypothetical protein  39.5 
 
 		 461 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347959  normal  0.266903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4036  acyl-CoA thioesterase  35.06 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  29.86 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  28.47 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  28.41 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  27.92 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  29.02 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  28.02 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  29.66 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  30 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  25 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  28.35 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  28.63 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  26.56 
 
 		 296 aa  86.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  28.63 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  28.63 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  27.52 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  26.64 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  29.64 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  28.16 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  28.02 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  27.12 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  26.22 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  26.48 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  26.64 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2907  acyl-CoA thioesterase  25.69 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121085  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  27.15 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  27.31 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  29.8 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  27.31 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  26.27 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  26.92 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  30.45 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  28.99 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  26.92 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  27.06 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  27.06 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  27.4 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  27.06 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  27.06 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  26.71 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3540  Palmitoyl-CoA hydrolase  28.91 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  26.92 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  30.08 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  25.91 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  27.24 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  27.24 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  29.32 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  30.08 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  27.91 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  27.91 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  26.85 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8358  acyl-CoA thioesterase II  28.69 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  26.85 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  26.85 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  26.36 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  26.64 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  26.64 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  26.3 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  26.6 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  26.94 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  27.41 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  27.52 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  27.91 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  26.92 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  26.22 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  27.63 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  27.59 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  27.91 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  27.34 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0306  acyl-CoA thioesterase  29.12 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2732  palmitoyl-CoA hydrolase  24.91 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0611615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1035  palmitoyl-CoA hydrolase  26.14 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  26.78 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  26.34 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  26.34 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  26.34 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  26.34 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  26.34 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  26.34 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  26.34 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  26.34 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  26.34 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  26.27 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  28.37 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  24.8 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  25.82 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1270  Choloyl-CoA hydrolase  26.87 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.248751  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  24.56 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  25.87 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  26.44 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  25.29 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  25.57 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>