155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3978 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3978  Acyl-CoA thioesterase-like  100 
 
 		 334 aa  669    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1358  acyl-CoA thioesterase  29.84 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395379  hitchhiker  0.0000152219 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  31.54 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  25.62 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4036  acyl-CoA thioesterase  27.57 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2001  palmitoyl-CoA hydrolase  28.85 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.657953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  26.38 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1854  acyl-CoA thioesterase  24.65 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12624  acyl-CoA thioesterase II tesB2  30.12 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  24.3 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  28.82 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2010  hypothetical protein  22.78 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347959  normal  0.266903 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  27.62 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  25.98 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  26.89 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  25.6 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2638  Palmitoyl-CoA hydrolase  28.98 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  0.433426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0935  acyl-CoA thioesterase  28.42 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  26.88 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  26.57 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2565  acyl-CoA thioesterase II  27.09 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  25.52 
 
 		 293 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2249  acyl-CoA thioesterase II  28.69 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365525  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24660  acyl-CoA thioesterase  28.75 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606526  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2296  acyl-CoA thioesterase II  28.69 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2604  hypothetical protein  26.69 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  26.69 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2288  acyl-CoA thioesterase II  28.69 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  25.88 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  24 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  23.81 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  23.41 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  23.41 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  23.41 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  26.43 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  26.79 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  26.25 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  26.8 
 
 		 282 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3790  hypothetical protein  25.85 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  25.42 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  25.87 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  25.61 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  26.84 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  25.87 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  27.13 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  22.71 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  22.71 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  22.71 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  26.67 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  22.71 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  22.71 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  22.71 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  25.1 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  22.71 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  22.71 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  23.41 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  26.27 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  26.22 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  26.69 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  24.9 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  24.9 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  24.9 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  24.6 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  26.12 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  25.29 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  25.76 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  24.9 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  26.48 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2041  palmitoyl-CoA hydrolase  24.3 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  23.92 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  26.46 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  26.49 
 
 		 314 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  26.6 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  26.74 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  25.5 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1097  acyl-CoA thioesterase  27.08 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.157874  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  24.76 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  27.38 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  22.92 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  22.83 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  22.35 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  24.8 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  21.74 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  21.74 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  27.54 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  25.09 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  22.35 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  25.79 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2301  hypothetical protein  24.68 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2348  hypothetical protein  24.68 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.17719  normal  0.440051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2340  hypothetical protein  24.68 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256955 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  23.72 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  24.8 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  24.66 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  23.92 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  22.57 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  24.8 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  23.92 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  24.41 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>