266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1012 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1012  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  984    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  28.35 
 
 		 417 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  30.23 
 
 		 412 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  31.37 
 
 		 766 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  30.47 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 		 861 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  30.36 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  31.44 
 
 		 444 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  33.51 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  28.44 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  28.92 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  29.15 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  28.87 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  27.86 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  31 
 
 		 852 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1200 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  28.37 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 		 621 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  28.29 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  27.27 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  28.36 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  27.57 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  30.36 
 
 		 624 aa  73.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  30.8 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 		 842 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  27.18 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  31.44 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  30.81 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  28.16 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  31.82 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  24.02 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  25.91 
 
 		 358 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  37.31 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  41.76 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  27.78 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  29.41 
 
 		 965 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  41.59 
 
 		 330 aa  67  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  26.22 
 
 		 263 aa  67  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  26.71 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3794  hypothetical protein  31.64 
 
 		 286 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000288368  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  27.41 
 
 		 616 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 		 311 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  28.23 
 
 		 1186 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  27.53 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  29.83 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  32.02 
 
 		 781 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  28.44 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  27.42 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  28.44 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  24.09 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0142  hypothetical protein  33.65 
 
 		 633 aa  64.3  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0534916  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  32.64 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  31.11 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  31.11 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  31.11 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  27.24 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  28.21 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  27.18 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  32 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  29.85 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  29.71 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  27.8 
 
 		 1104 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  24.79 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  27.04 
 
 		 413 aa  62  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  26.32 
 
 		 1049 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  27.2 
 
 		 1818 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  28.4 
 
 		 1007 aa  60.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  26.24 
 
 		 605 aa  60.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  34.46 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  35.97 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  30.83 
 
 		 384 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  28.04 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.76 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  23.55 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  24.64 
 
 		 1053 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  33.33 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  25 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.57 
 
 		 1044 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  24.29 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 		 1314 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  26.97 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  29.7 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  30.05 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.31 
 
 		 1023 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  24.84 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  32.1 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  29.37 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  25.47 
 
 		 657 aa  57  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  31.35 
 
 		 308 aa  57  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  33.64 
 
 		 409 aa  57  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  29.22 
 
 		 330 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  25.09 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  27.8 
 
 		 491 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  29.48 
 
 		 289 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  30 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>