More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0111 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0111  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  100 
 
 		 257 aa  510  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.352999  normal  0.500549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0641  IS605 family transposase OrfB  78.23 
 
 		 384 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133268  normal  0.392009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1851  IS605 family transposase OrfB  78.23 
 
 		 384 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  45.33 
 
 		 425 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  46.75 
 
 		 417 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  39.16 
 
 		 403 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  51.09 
 
 		 410 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  49.28 
 
 		 405 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  48.18 
 
 		 368 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  48.55 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  48.55 
 
 		 326 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  44.44 
 
 		 381 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  47.1 
 
 		 410 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  47.83 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  41.38 
 
 		 395 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  41.43 
 
 		 381 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  48.55 
 
 		 405 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  42.18 
 
 		 390 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  38.92 
 
 		 394 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  42.36 
 
 		 370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  44.16 
 
 		 424 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  36.81 
 
 		 367 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  36.81 
 
 		 367 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  36.81 
 
 		 377 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  40 
 
 		 361 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  40.97 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  43.23 
 
 		 381 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  45.65 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  47.83 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  51.09 
 
 		 410 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  30.93 
 
 		 435 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  40.29 
 
 		 391 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  42.95 
 
 		 376 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  36.93 
 
 		 416 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  40.74 
 
 		 373 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  37.66 
 
 		 391 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  42.75 
 
 		 403 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  37.41 
 
 		 391 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  38.46 
 
 		 393 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  44 
 
 		 406 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  41.98 
 
 		 408 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  33.11 
 
 		 326 aa  99.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  31.97 
 
 		 370 aa  99  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  45.89 
 
 		 377 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  38.26 
 
 		 376 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  33.78 
 
 		 393 aa  97.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  32.89 
 
 		 311 aa  95.9  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  38.46 
 
 		 392 aa  95.1  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  39.31 
 
 		 385 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  38.46 
 
 		 450 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  37.06 
 
 		 427 aa  94.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  37.06 
 
 		 392 aa  94.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  38.46 
 
 		 392 aa  94.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  33.9 
 
 		 404 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  33.9 
 
 		 404 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  37.06 
 
 		 390 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  40.91 
 
 		 399 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  35.62 
 
 		 416 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  37.93 
 
 		 385 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  34.88 
 
 		 370 aa  92.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  32.95 
 
 		 396 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  34.69 
 
 		 402 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  35.66 
 
 		 370 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1991  transposase  36.49 
 
 		 383 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  37.24 
 
 		 371 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  38.78 
 
 		 381 aa  90.9  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  31.03 
 
 		 402 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  38.78 
 
 		 381 aa  90.9  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  34.62 
 
 		 370 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1366  transposase  37.76 
 
 		 403 aa  89.7  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4234  IS605 family transposase OrfB  39.04 
 
 		 299 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  36.67 
 
 		 380 aa  88.6  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  29.83 
 
 		 384 aa  89  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  30.59 
 
 		 370 aa  88.6  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  29.28 
 
 		 384 aa  88.6  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  36.67 
 
 		 380 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  31.76 
 
 		 370 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  42.75 
 
 		 442 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  30.81 
 
 		 383 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  42.75 
 
 		 442 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  30.81 
 
 		 383 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4361  transposase, IS605 OrfB family  36.05 
 
 		 386 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0822  putative transposase IS605 family  26.74 
 
 		 411 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0682059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  29.24 
 
 		 440 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1093  transposase  35.81 
 
 		 397 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.946066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1501  transposase  34.87 
 
 		 397 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.915709  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3231  putative transposase IS605 family  26.74 
 
 		 411 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963843 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  29.28 
 
 		 384 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  40.94 
 
 		 399 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  32.65 
 
 		 300 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  31.97 
 
 		 393 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  31.76 
 
 		 370 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  31.29 
 
 		 370 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  31.97 
 
 		 370 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0100  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.88 
 
 		 401 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  31.97 
 
 		 384 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>