More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1044 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1044  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.313495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5853  Uracil phosphoribosyltransferase  50.7 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2121  uracil phosphoribosyltransferase  53 
 
 
217 aa  239  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000112291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3881  uracil phosphoribosyltransferase  48.58 
 
 
214 aa  228  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0752  uracil phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
216 aa  210  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4038  uracil phosphoribosyltransferase  47.22 
 
 
214 aa  209  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.393403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1195  uracil phosphoribosyltransferase  48.11 
 
 
217 aa  207  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.229632 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1704  uracil phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0207  uracil phosphoribosyltransferase  38.14 
 
 
231 aa  138  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.793413  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0896  uracil phosphoribosyltransferase  37.67 
 
 
231 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 
220 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  38.97 
 
 
220 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0667  uracil phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
210 aa  132  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1512  uracil phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.299119  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1210  uracil phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.926992  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  39.44 
 
 
216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 
209 aa  129  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  39.44 
 
 
216 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2128  uracil phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.641959  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1643  uracil phosphoribosyltransferase  34.63 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.637349  normal  0.301686 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0608  uracil phosphoribosyltransferase  32.84 
 
 
210 aa  126  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1551  uracil phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
224 aa  125  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
209 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
207 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  37.09 
 
 
209 aa  124  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 
211 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
209 aa  122  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
209 aa  122  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
208 aa  122  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 
226 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  32.85 
 
 
208 aa  122  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02390  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
208 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.158587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1171  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
208 aa  121  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.357619  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2645  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
208 aa  121  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.325171  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2781  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
208 aa  121  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.205174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3720  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
208 aa  121  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109857  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2633  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
208 aa  121  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1178  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
208 aa  121  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0242269 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2872  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
208 aa  121  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02352  hypothetical protein  35.75 
 
 
208 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.229942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
209 aa  121  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
209 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
209 aa  121  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
209 aa  121  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
209 aa  121  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
209 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
209 aa  121  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
209 aa  121  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
209 aa  121  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2986  uracil phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0699433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2757  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131964  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2645  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0438743  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2735  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  38.42 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2389  uracil phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2866  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2693  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1720  uracil phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 
225 aa  119  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
207 aa  119  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03199  uracil phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 
210 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41360  uracil phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 
212 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  35.55 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0315  uracil phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
370 aa  118  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
209 aa  118  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
209 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
209 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1979  uracil phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 
212 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.267185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  36.89 
 
 
207 aa  117  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002782  uracil phosphoribosyltransferase  34.68 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3523  uracil phosphoribosyltransferase  36.53 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00113059  normal  0.884309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  35.55 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5295  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4443  uracil phosphoribosyltransferase  33.81 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  36.15 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1130  uracil phosphoribosyltransferase  36.07 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61470  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.273036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2991  uracil phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4237  uracil phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1235  uracil phosphoribosyltransferase  36.07 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0527635  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1352  uracil phosphoribosyltransferase  36.07 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0234913  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0774  uracil phosphoribosyltransferase  33.81 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664758  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3186  uracil phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>