More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0608 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0608  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 210 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0667  uracil phosphoribosyltransferase  79.81 
 
 		 210 aa  345  3e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1643  uracil phosphoribosyltransferase  79.15 
 
 		 211 aa  343  1e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.637349  normal  0.301686 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2128  uracil phosphoribosyltransferase  77.73 
 
 		 211 aa  329  2e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.641959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0611  uracil phosphoribosyltransferase  58.69 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.736678  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1210  uracil phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.926992  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1720  uracil phosphoribosyltransferase  50.47 
 
 		 225 aa  207  7e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1551  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 224 aa  207  9e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0119  uracil phosphoribosyltransferase  50.93 
 
 		 225 aa  205  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0026  uracil phosphoribosyltransferase  50.7 
 
 		 215 aa  204  9e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00981557 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0877  uracil phosphoribosyltransferase  50.23 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197275 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2717  uracil phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 		 225 aa  191  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.841671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1704  uracil phosphoribosyltransferase  47.32 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0207  uracil phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.793413  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1512  uracil phosphoribosyltransferase  44.33 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.299119  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0896  uracil phosphoribosyltransferase  47.32 
 
 		 231 aa  177  9e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0047  phosphoribosyltransferase  46.48 
 
 		 217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  41.63 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1211  uracil phosphoribosyltransferase  40.87 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  40.67 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  39.61 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  39.61 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  37.32 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3881  uracil phosphoribosyltransferase  39.41 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  38.76 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1394  uracil phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.588374  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  40.19 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  40.29 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  38.76 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 		 370 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 		 209 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  37.44 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  38.65 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1242  uracil phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0425998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1883  uracil phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0360  uracil phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00755742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1387  uracil phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  35.89 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1077  uracil phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0790  uracil phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0641631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  37.26 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1233  uracil phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  35.41 
 
 		 209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 		 211 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  35.41 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1016  uracil phosphoribosyltransferase  36.23 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0280  uracil phosphoribosyltransferase  37.68 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  37.32 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl107  uracil phosphoribosyltransferase  37.56 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0315  uracil phosphoribosyltransferase  36.06 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  38.65 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  35.27 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  36.19 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>