More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1211 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1211  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
206 aa  409  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
209 aa  172  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  40.58 
 
 
213 aa  168  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
209 aa  168  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
209 aa  168  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  40.87 
 
 
209 aa  166  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
226 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1559  uracil phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0188638  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  43.84 
 
 
207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 
208 aa  162  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1303  uracil phosphoribosyltransferase  41.83 
 
 
208 aa  162  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 
208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  40.87 
 
 
209 aa  160  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
209 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 
209 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
209 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 
203 aa  159  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0608  uracil phosphoribosyltransferase  40.87 
 
 
210 aa  159  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
209 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1478  uracil phosphoribosyltransferase  41.35 
 
 
208 aa  158  5e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
209 aa  157  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  39.61 
 
 
210 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  38.35 
 
 
208 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 
209 aa  154  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
209 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
209 aa  154  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
209 aa  154  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
209 aa  154  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
209 aa  154  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
209 aa  154  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
209 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
209 aa  154  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
209 aa  154  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
209 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
211 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0280  uracil phosphoribosyltransferase  42.16 
 
 
207 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 
207 aa  154  1e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
209 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1394  uracil phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 
208 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.588374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2194  uracil phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.125037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1589  uracil phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
209 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
209 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  36.06 
 
 
209 aa  150  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0079  uracil phosphoribosyltransferase  37.68 
 
 
212 aa  150  8.999999999999999e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000379157 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
209 aa  150  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2128  uracil phosphoribosyltransferase  40.19 
 
 
211 aa  150  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.641959  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
209 aa  150  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0996  uracil phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 
208 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.688134  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
209 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
209 aa  149  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 
208 aa  148  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  38.73 
 
 
211 aa  148  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  38.65 
 
 
213 aa  147  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8568  uracil phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
217 aa  147  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0766288  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  38.42 
 
 
370 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0275  uracil phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.68494  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0482  uracil phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.715144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9322  Uracil phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  37.38 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 
303 aa  145  3e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
209 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
209 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  37.38 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  37.38 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0667  uracil phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
211 aa  145  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03340  uracil phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 
218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.594912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0647  uracil phosphoribosyltransferase  37.75 
 
 
211 aa  144  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3539  uracil phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 
212 aa  144  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.434465  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2255  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
218 aa  143  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.549393  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 
210 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
209 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1078  uracil phosphoribosyltransferase  38.61 
 
 
208 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
215 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  36.23 
 
 
213 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1643  uracil phosphoribosyltransferase  38.76 
 
 
211 aa  142  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.637349  normal  0.301686 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2259  uracil phosphoribosyltransferase  37.26 
 
 
212 aa  142  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0379933  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1016  uracil phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 
216 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 
209 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0515  uracil phosphoribosyltransferase  36.06 
 
 
211 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00743886  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 
209 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
215 aa  141  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  34.3 
 
 
210 aa  141  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  36.23 
 
 
216 aa  141  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05530  uracil phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 
207 aa  141  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  36.06 
 
 
209 aa  141  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 
209 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4832  uracil phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
217 aa  141  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
211 aa  141  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5281  uracil phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 
209 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  36.06 
 
 
209 aa  141  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1883  uracil phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 
216 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2169  uracil phosphoribosyltransferase  38.81 
 
 
209 aa  140  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.215799 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1077  uracil phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 
216 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0790  uracil phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 
216 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0641631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>