More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3881 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3881  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
214 aa  447  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5853  Uracil phosphoribosyltransferase  64.02 
 
 
215 aa  307  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2121  uracil phosphoribosyltransferase  51.89 
 
 
217 aa  237  9e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000112291  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0752  uracil phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 
216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1044  uracil phosphoribosyltransferase  48.58 
 
 
217 aa  228  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.313495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4038  uracil phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
214 aa  223  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.393403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1195  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
217 aa  221  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.229632 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0608  uracil phosphoribosyltransferase  39.41 
 
 
210 aa  142  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1210  uracil phosphoribosyltransferase  39.72 
 
 
216 aa  138  7e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.926992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1704  uracil phosphoribosyltransferase  36.63 
 
 
231 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1512  uracil phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.299119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0207  uracil phosphoribosyltransferase  36.76 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.793413  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2128  uracil phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 
211 aa  132  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.641959  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0667  uracil phosphoribosyltransferase  37.44 
 
 
210 aa  132  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0896  uracil phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1643  uracil phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.637349  normal  0.301686 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0611  uracil phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 
219 aa  125  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.736678  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0026  uracil phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
215 aa  125  6e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00981557 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
213 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2209  uracil phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
216 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1551  uracil phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
224 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1681  uracil phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
232 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0731793  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2316  uracil phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
216 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.542066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2331  uracil phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
216 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829387  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2293  uracil phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
238 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  36.95 
 
 
209 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5620  uracil phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
216 aa  121  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0985  uracil phosphoribosyltransferase  35.02 
 
 
216 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286642  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1883  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1242  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0425998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1387  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0360  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00755742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1016  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1077  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0790  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0641631  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1233  uracil phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 
216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  34.88 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
209 aa  118  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
209 aa  118  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2255  uracil phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 
218 aa  118  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.549393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0076  uracil phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2063  uracil phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
216 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36489  normal  0.305714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 
209 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0047  phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
217 aa  116  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1720  uracil phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
225 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
209 aa  115  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  34.98 
 
 
209 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 
209 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1302  uracil phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0489544  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3258  uracil phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0567794  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  35.89 
 
 
211 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0119  uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf240  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210936  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0877  uracil phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.197275 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  34.98 
 
 
210 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0546  uracil phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 
208 aa  112  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
209 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  34.3 
 
 
216 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  34.3 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
209 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0832  uracil phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 
206 aa  112  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0298265 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  33 
 
 
209 aa  112  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  35.35 
 
 
209 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
209 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1211  uracil phosphoribosyltransferase  32.84 
 
 
206 aa  112  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0689  uracil phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
212 aa  111  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  35.27 
 
 
216 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  33.95 
 
 
207 aa  111  6e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 
220 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1986  uracil phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252014  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  34.98 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0377  uracil phosphoribosyltransferase  36 
 
 
206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  34.85 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>