More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5853 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5853  Uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3881  uracil phosphoribosyltransferase  64.02 
 
 
214 aa  307  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1044  uracil phosphoribosyltransferase  50.7 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.313495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4038  uracil phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 
214 aa  239  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.393403 
 
 
-
 
NC_002950  PG0752  uracil phosphoribosyltransferase  54.81 
 
 
216 aa  236  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2121  uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
217 aa  236  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000112291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1195  uracil phosphoribosyltransferase  50 
 
 
217 aa  218  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.229632 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1704  uracil phosphoribosyltransferase  35.94 
 
 
231 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0896  uracil phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 
231 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0207  uracil phosphoribosyltransferase  36.07 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.793413  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1512  uracil phosphoribosyltransferase  33.95 
 
 
232 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.299119  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1551  uracil phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
224 aa  128  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0877  uracil phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.197275 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1210  uracil phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.926992  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 
216 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0985  uracil phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286642  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5620  uracil phosphoribosyltransferase  38.3 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1681  uracil phosphoribosyltransferase  37.77 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0731793  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2331  uracil phosphoribosyltransferase  37.77 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829387  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2293  uracil phosphoribosyltransferase  37.77 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2209  uracil phosphoribosyltransferase  37.77 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2316  uracil phosphoribosyltransferase  37.77 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.542066 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0608  uracil phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 
210 aa  119  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2717  uracil phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.841671  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0667  uracil phosphoribosyltransferase  35.87 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1986  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252014  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1720  uracil phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
225 aa  118  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
209 aa  118  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
209 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
209 aa  118  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
209 aa  118  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
209 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
209 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
209 aa  118  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
209 aa  118  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
209 aa  118  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0611  uracil phosphoribosyltransferase  35.55 
 
 
219 aa  118  6e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.736678  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
209 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0026  uracil phosphoribosyltransferase  32.11 
 
 
215 aa  118  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00981557 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1016  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0360  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00755742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1883  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1387  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  34.39 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1242  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0425998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0119  uracil phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1077  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0790  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0641631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2063  uracil phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36489  normal  0.305714 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  35.02 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  32.72 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2386  uracil phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  36.5 
 
 
220 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1233  uracil phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 
216 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  34 
 
 
220 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 
216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
207 aa  115  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0788  uracil phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
216 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
209 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2128  uracil phosphoribosyltransferase  32.35 
 
 
211 aa  115  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.641959  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  34.92 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 
211 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1302  uracil phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
216 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0489544  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3258  uracil phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
216 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0567794  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  33.86 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2519  uracil phosphoribosyltransferase  34.57 
 
 
216 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  36.56 
 
 
209 aa  111  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  36.56 
 
 
209 aa  111  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0800  uracil phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2255  uracil phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
218 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.549393  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  34.41 
 
 
203 aa  109  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
209 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  34.41 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  31.02 
 
 
209 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 
370 aa  108  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0315  uracil phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
211 aa  108  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 
209 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
209 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
209 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1643  uracil phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 
211 aa  107  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.637349  normal  0.301686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  34.22 
 
 
226 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0076  uracil phosphoribosyltransferase  33.16 
 
 
207 aa  107  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4937  uracil phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
215 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0047  phosphoribosyltransferase  32.68 
 
 
217 aa  106  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4237  uracil phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
209 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
209 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  34.57 
 
 
209 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>