More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2121 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2121  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000112291  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0752  uracil phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 		 216 aa  258  7e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1044  uracil phosphoribosyltransferase  53 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.313495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3881  uracil phosphoribosyltransferase  51.89 
 
 		 214 aa  237  9e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5853  Uracil phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 		 215 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1195  uracil phosphoribosyltransferase  50.46 
 
 		 217 aa  234  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.229632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4038  uracil phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.393403 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1512  uracil phosphoribosyltransferase  38.76 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.299119  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1551  uracil phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1704  uracil phosphoribosyltransferase  37.82 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0207  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.793413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1210  uracil phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.926992  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0026  uracil phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00981557 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0896  uracil phosphoribosyltransferase  35.41 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1233  uracil phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 		 216 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1016  uracil phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 		 216 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1643  uracil phosphoribosyltransferase  36.95 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.637349  normal  0.301686 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  38.38 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1883  uracil phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1242  uracil phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0425998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1387  uracil phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0360  uracil phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00755742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1077  uracil phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0790  uracil phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0641631  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2128  uracil phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.641959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2063  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36489  normal  0.305714 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5620  uracil phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3184  uracil phosphoribosyltransferase  33.83 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0608  uracil phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3258  uracil phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0567794  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0985  uracil phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1302  uracil phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0489544  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2209  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0667  uracil phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  38.38 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2331  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829387  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2293  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2316  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.542066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1681  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0731793  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  34.85 
 
 		 370 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  35.21 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1720  uracil phosphoribosyltransferase  36.19 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  37.82 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0877  uracil phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2519  uracil phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0611  uracil phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.736678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 		 209 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 		 207 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  37.23 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  33.87 
 
 		 220 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  36.63 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf240  uracil phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1986  uracil phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0788  uracil phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0190472  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0119  uracil phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2386  uracil phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  33.87 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  33.85 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 		 213 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0251  uracil phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  34.87 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1598  uracil phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0746  uracil phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.559467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0280  uracil phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4443  uracil phosphoribosyltransferase  34.22 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1065  uracil phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0774  uracil phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  33.84 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0787  uracil phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785203 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41360  uracil phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  36.22 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2096  uracil phosphoribosyltransferase  34.5 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>