More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0207 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0207  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
231 aa  471  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.793413  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0896  uracil phosphoribosyltransferase  96.1 
 
 
231 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1704  uracil phosphoribosyltransferase  95.24 
 
 
231 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1512  uracil phosphoribosyltransferase  81.03 
 
 
232 aa  391  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.299119  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0026  uracil phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00981557 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1551  uracil phosphoribosyltransferase  46.8 
 
 
224 aa  195  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0611  uracil phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 
219 aa  191  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.736678  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1210  uracil phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.926992  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0119  uracil phosphoribosyltransferase  47.55 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2717  uracil phosphoribosyltransferase  47.55 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.841671  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2128  uracil phosphoribosyltransferase  48.04 
 
 
211 aa  187  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.641959  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1720  uracil phosphoribosyltransferase  47.78 
 
 
225 aa  186  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0877  uracil phosphoribosyltransferase  47.55 
 
 
225 aa  182  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.197275 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0608  uracil phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
210 aa  180  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1643  uracil phosphoribosyltransferase  45.32 
 
 
211 aa  176  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.637349  normal  0.301686 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0667  uracil phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 
210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2196  uracil phosphoribosyltransferase  39.6 
 
 
214 aa  145  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2168  uracil phosphoribosyltransferase  39.6 
 
 
214 aa  145  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
209 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5853  Uracil phosphoribosyltransferase  36.07 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4237  uracil phosphoribosyltransferase  39.5 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1044  uracil phosphoribosyltransferase  38.14 
 
 
217 aa  138  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.313495  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0208  uracil phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 
209 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 
207 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0315  uracil phosphoribosyltransferase  36.5 
 
 
211 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0206  uracil phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 
209 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  38.42 
 
 
209 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1394  uracil phosphoribosyltransferase  40.8 
 
 
208 aa  136  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.588374  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1195  uracil phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 
217 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.229632 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 
209 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 
213 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  37.13 
 
 
215 aa  135  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  36.63 
 
 
216 aa  135  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 
209 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5281  uracil phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 
209 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  38 
 
 
215 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3881  uracil phosphoribosyltransferase  36.76 
 
 
214 aa  135  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3489  uracil phosphoribosyltransferase  39.8 
 
 
218 aa  134  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.125966  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  38 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  36.63 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 
209 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  39 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  38 
 
 
208 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
209 aa  133  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0280  uracil phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
208 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  37.13 
 
 
209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  34.65 
 
 
208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  38 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
209 aa  129  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 
209 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 
209 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 
209 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
210 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  35 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2121  uracil phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000112291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 
209 aa  129  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2976  uracil phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 
214 aa  128  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310463  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 
208 aa  128  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  36.82 
 
 
209 aa  128  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  35.89 
 
 
209 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 
211 aa  128  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 
226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  36.45 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  37.44 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5620  uracil phosphoribosyltransferase  34.7 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  36.95 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 
207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  36.76 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2293  uracil phosphoribosyltransferase  34.7 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2209  uracil phosphoribosyltransferase  34.7 
 
 
216 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  34.65 
 
 
210 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2316  uracil phosphoribosyltransferase  34.7 
 
 
216 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.542066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0985  uracil phosphoribosyltransferase  34.7 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286642  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1681  uracil phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0731793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 
220 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
209 aa  125  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
211 aa  125  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>