211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3400 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3400  response regulator receiver protein  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0659  fimbrial Z protein; signal transducer  39.76 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.379451 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2960  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.917749  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1861  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.419693  normal  0.0598663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3033  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.011043  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  38.55 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  38.55 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2255  putative transcriptional regulator  36.05 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0808718  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  29.36 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 246 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  29.36 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26570  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.604718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  52.17 
 
 		 1006 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  48.08 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3055  response regulator receiver  26.06 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4868  transcriptional regulator, LuxR family  36.9 
 
 		 140 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.221718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0636  transcriptional regulator FimZ  48.08 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.931873  normal  0.250092 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00490  hypothetical protein  48.08 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  48.08 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4903  LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.650668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0577  transcriptional regulator FimZ  48.08 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.74 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  48.08 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4955  LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0580  transcriptional regulator FimZ  48.08 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0524  DNA-binding transcriptional activator BglJ  48.08 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.441884  decreased coverage  0.00182445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  53.19 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2835  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803464  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.39 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  53.19 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  53.19 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.44 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000124934  normal  0.0275678 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  53.19 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  53.19 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  42.55 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  39.13 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.68 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264008  normal  0.348846 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  33.67 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  39.62 
 
 		 228 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  53.19 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2705  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.306618  normal  0.0198743 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  46.77 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1600  LuxR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240626  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1353  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738988  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1465  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  23.24 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4679  LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04243  DNA-binding transcriptional activator  40.82 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0432345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3631  transcriptional regulator, LuxR family  40.82 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00452114  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  27.4 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.55 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6883  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.06 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239531  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.706783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2876  response regulator receiver  47.73 
 
 		 284 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04209  hypothetical protein  40.82 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1088  transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.25 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4599  DNA-binding transcriptional activator BglJ  40.82 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4960  DNA-binding transcriptional activator BglJ  40.82 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013279  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1286  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5879  DNA-binding transcriptional activator BglJ  40.82 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0356322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3689  DNA-binding transcriptional activator BglJ  40.82 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.256974  decreased coverage  0.00000689885 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  49.02 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4912  DNA-binding transcriptional activator BglJ  40.82 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000035455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.55 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>