132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1625 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1625  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
372 aa  760    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.186287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1259  glycosyl transferase, group 1  38.55 
 
 
371 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.239983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  22.63 
 
 
382 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1399  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130601  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
347 aa  57  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 
385 aa  56.6  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
408 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
455 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  27.56 
 
 
384 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  37.5 
 
 
400 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
386 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
838 aa  53.9  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
394 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  22.17 
 
 
375 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
386 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
405 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  28.18 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 
351 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6405  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
384 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
426 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  26.27 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 
967 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
389 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3905  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
366 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.840872  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
393 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  43.33 
 
 
384 aa  50.1  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0738  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
358 aa  50.1  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1397  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
368 aa  50.1  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195676  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0557  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
399 aa  50.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
373 aa  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  31.06 
 
 
429 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2684  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 
358 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  34.21 
 
 
460 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  34.21 
 
 
460 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1869  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.740215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  32.52 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  28.12 
 
 
430 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
419 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  29.1 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  40.74 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  20.93 
 
 
303 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
399 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
389 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  29.1 
 
 
375 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
408 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  32.98 
 
 
375 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1445  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
321 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4221  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
407 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775919  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
537 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0456  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 
373 aa  46.6  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0645545  hitchhiker  0.00671618 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  44.26 
 
 
325 aa  46.2  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.38 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1108  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
812 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4109  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719344  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  20.42 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5047  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318515  normal  0.241933 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  23.11 
 
 
370 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
871 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
426 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3690  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.633764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  44.9 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1187  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  39.71 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 
772 aa  45.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  28.48 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
426 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3586  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
383 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
356 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3659  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
383 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.650107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3591  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
383 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  27.92 
 
 
416 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  43.33 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  25.81 
 
 
803 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>