More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0665 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
320 aa  637    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.42 
 
 
320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
328 aa  333  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
351 aa  268  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  42.09 
 
 
305 aa  259  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.09 
 
 
305 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.57 
 
 
307 aa  242  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2420  nickel-transporting ATPase  38.05 
 
 
305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827843  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1953  oligopeptide transporter permease  40.44 
 
 
306 aa  238  9e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  40.44 
 
 
306 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1959  oligopeptide transporter permease  39.18 
 
 
306 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
307 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2162  oligopeptide transporter permease  39.18 
 
 
306 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136059  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  39.5 
 
 
306 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.92 
 
 
308 aa  235  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2069  oligopeptide transporter permease  38.87 
 
 
306 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186457  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  39.5 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  38.87 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.14 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
311 aa  232  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  39.18 
 
 
306 aa  232  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  40.44 
 
 
306 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  40.44 
 
 
306 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  40.44 
 
 
306 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  40.44 
 
 
306 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01218  oligopeptide permease ABC transporter membrane protein  39.81 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2404  Alkaline phosphatase  39.81 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000374689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1896  oligopeptide transporter permease  39.81 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22801  normal  0.152903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1353  oligopeptide transporter permease  39.81 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00072076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2384  oligopeptide transporter permease  39.81 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.423477  hitchhiker  0.00000144694 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01228  hypothetical protein  39.81 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1730  oligopeptide transporter permease  39.81 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  0.0825578 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1392  oligopeptide transporter permease  39.81 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.897764  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1413  oligopeptide transporter permease  39.81 
 
 
306 aa  231  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.933952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
307 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.298513  hitchhiker  0.00733729 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
307 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  40.13 
 
 
306 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675854 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  35.11 
 
 
305 aa  230  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
305 aa  229  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
308 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
308 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46607  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  37.3 
 
 
306 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
311 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.679809  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.48 
 
 
306 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  36.68 
 
 
306 aa  225  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.16 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.16 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  36.16 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.16 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.14 
 
 
306 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000794188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.16 
 
 
306 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
309 aa  223  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000243016  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 
314 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  36.48 
 
 
306 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  36.48 
 
 
306 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0391  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.45 
 
 
303 aa  221  9e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.920936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.85 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  36.48 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7029  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.12 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  36.48 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  36.48 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
309 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  36.36 
 
 
306 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4686  alkaline phosphatase  36.25 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0426131  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.99 
 
 
332 aa  218  7.999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
335 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
306 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2889  alkaline phosphatase  35 
 
 
307 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
306 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
306 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
306 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2029  phosphoglycerate mutase 1  35.22 
 
 
311 aa  216  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664114  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
306 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
306 aa  215  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1404  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  37.5 
 
 
307 aa  215  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0149  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.160386  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1480  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppB  34.38 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
339 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.12 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681707  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591349  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  35.33 
 
 
307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
321 aa  212  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0570  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.99 
 
 
308 aa  212  9e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
307 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
307 aa  212  9e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002960  oligopeptide transport system permease protein OppB  36.51 
 
 
291 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
307 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>