More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3341 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
351 aa  689    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.9 
 
 
320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
328 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
307 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.26 
 
 
305 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.541229  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0942  nickel-transporting ATPase  39.94 
 
 
305 aa  237  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.541988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
308 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.78 
 
 
306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
309 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 
306 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000794188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
305 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
305 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
325 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
305 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0229  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
305 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
308 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
308 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46607  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
307 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0210  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
305 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
306 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.472252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
306 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000653909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
339 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0186  oligopeptide ABC transporter permease  35.05 
 
 
307 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0205  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 
307 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0185  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.05 
 
 
307 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
309 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0639  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 
313 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5114  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
305 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
307 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
307 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2420  nickel-transporting ATPase  36.31 
 
 
305 aa  202  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827843  normal  0.256782 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1931  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  34.49 
 
 
305 aa  202  5e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0173  oligopeptide ABC transporter, permease  35.05 
 
 
305 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00506447  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4686  alkaline phosphatase  38.29 
 
 
307 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0426131  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0176  oligopeptide ABC transporter, permease  34.73 
 
 
305 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
321 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
308 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2700  oligopeptide transporter permease  35.99 
 
 
306 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0475614  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  36.71 
 
 
316 aa  199  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2301  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 
306 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121257  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0842  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.08 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00690225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0570  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 
308 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
305 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00478237  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02948  oligopeptide transporter permease  33.44 
 
 
306 aa  195  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
311 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.679809  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0022  alkaline phosphatase  34.08 
 
 
306 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01218  oligopeptide permease ABC transporter membrane protein  35.03 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2404  Alkaline phosphatase  35.03 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000374689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1730  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  0.0825578 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01228  hypothetical protein  35.03 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1392  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.897764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2384  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.423477  hitchhiker  0.00000144694 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1959  oligopeptide transporter permease  34.08 
 
 
306 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.162478  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1896  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22801  normal  0.152903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1353  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00072076  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0391  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.84 
 
 
303 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.920936  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2194  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 
306 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0464785  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2162  oligopeptide transporter permease  34.08 
 
 
306 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136059  normal  0.0309495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1413  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 
306 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.933952  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2069  oligopeptide transporter permease  34.08 
 
 
306 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.186457  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  33.12 
 
 
306 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
324 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1953  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 
306 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.92 
 
 
307 aa  192  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1400  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 
306 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1582  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 
306 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.733786  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1873  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 
306 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.741835  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1936  oligopeptide transporter permease  35.03 
 
 
306 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
307 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.298513  hitchhiker  0.00733729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1879  oligopeptide transporter permease  34.71 
 
 
306 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675854 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
325 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1986  oligopeptide transporter permease  34.39 
 
 
306 aa  190  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.879407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  35.26 
 
 
326 aa  190  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1480  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppB  37.97 
 
 
307 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2287  oligopeptide transporter permease  34.39 
 
 
306 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289151  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
324 aa  190  4e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0149  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
304 aa  189  5e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.160386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
307 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.591349  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2889  alkaline phosphatase  38.61 
 
 
307 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4107  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 
309 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1235  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 
309 aa  189  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1301  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 
309 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1102  oligopeptide ABC transporter permease  35.33 
 
 
309 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
340 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0218658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1084  oligopeptide ABC transporter, permease  35.33 
 
 
309 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1078  oligopeptide ABC transporter, permease  35.33 
 
 
309 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1262  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 
309 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1192  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.33 
 
 
309 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1339  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 
309 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000511987  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3600  alkaline phosphatase  38.61 
 
 
307 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.74 
 
 
333 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0536  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.61 
 
 
307 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178861  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0466  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.29 
 
 
307 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
306 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3675  oligopeptide ABC transporter, permease  35.76 
 
 
316 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0490538 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002960  oligopeptide transport system permease protein OppB  34 
 
 
291 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>