More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2600 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2600  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
331 aa  665    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3247  glycosyl transferase, group 1  98.49 
 
 
331 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.962082  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1207  glycosyl transferase, group 1  45.45 
 
 
323 aa  229  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  0.0214801 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 
398 aa  69.3  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
363 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
405 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
407 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  34.51 
 
 
350 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.23 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
379 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
414 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
440 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
389 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
409 aa  59.3  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  20.46 
 
 
364 aa  59.3  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
374 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
426 aa  59.3  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  35.71 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  30.38 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
357 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
383 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
739 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0305  putative glycosyl transferase  26.74 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02227  hypothetical protein  30.34 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
398 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
389 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
425 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
353 aa  56.2  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
374 aa  55.8  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
346 aa  55.8  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
435 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  31.58 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2082  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
391 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
394 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  35.83 
 
 
445 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
403 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
382 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
394 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
387 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
373 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 
376 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04171  putative glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
388 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.116045  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
393 aa  53.9  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 
395 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
389 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003534  glycosyltransferase  32.43 
 
 
356 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1370  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  21.21 
 
 
349 aa  53.1  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0952  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
345 aa  53.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223528 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
419 aa  52.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
375 aa  52.8  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
750 aa  52.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 
406 aa  52.8  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
377 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
396 aa  52.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04481  putative glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
385 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
388 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.4 
 
 
465 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  31.68 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
392 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
440 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  22.81 
 
 
387 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 
373 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
396 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
1079 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  21.38 
 
 
355 aa  51.2  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
385 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
385 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
407 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  26.92 
 
 
362 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
391 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4362  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
390 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
370 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.49 
 
 
375 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
391 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0775  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
390 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
390 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  20.21 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
374 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  21.99 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
391 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
371 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
399 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21451  putative glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
392 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>